32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3067 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  873    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  73.6 
 
 		 385 aa  521  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 448 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  35.55 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  38.65 
 
 		 458 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  38.4 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  39.4 
 
 		 445 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  36.28 
 
 		 442 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 427 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  34.57 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 427 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  35.02 
 
 		 435 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 427 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 463 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  34.82 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  35.14 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  33.93 
 
 		 436 aa  183  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  25.38 
 
 		 939 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  25.98 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  22.68 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49533  nucleotide transporter 1  21.82 
 
 		 610 aa  53.5  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45145  nucleotide transporter 2  22.78 
 
 		 575 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0739731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  25.42 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54907  nucleotide transporter 6  22.5 
 
 		 599 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  19.92 
 
 		 450 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 459 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>