29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0449 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0449  ABC-3 protein  100 
 
 		 263 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.856508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4332  ABC-3 protein  76.52 
 
 		 265 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3462  ABC-3 protein  80.08 
 
 		 259 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0567  ABC-3 protein  80.08 
 
 		 255 aa  384  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0618  ABC-3 protein  77.9 
 
 		 286 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.087201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3309  ABC-3 protein  80 
 
 		 262 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0566  ABC 3 transport family protein  80.08 
 
 		 259 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0568  ABC-3 protein  79.67 
 
 		 255 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3515  ABC-3 protein  76.92 
 
 		 261 aa  368  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3740  ABC-3 protein  80.97 
 
 		 266 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3923  ABC-3 protein  76.54 
 
 		 266 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3797  ABC-3 protein  76.92 
 
 		 266 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.48799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0528  ABC-3 protein  76.54 
 
 		 266 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3140  ABC 3 transport family protein  76.4 
 
 		 251 aa  361  8e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0529  hypothetical protein  75.71 
 
 		 263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00670346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3714  ABC-3 protein  74.52 
 
 		 263 aa  339  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0390511  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06464  hypothetical protein  40.77 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000604  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  41.57 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000103291  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2539  zinc/manganese transport system permease protein  52.21 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.421777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1547  ABC-3 protein  36.05 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363711  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0050  putative manganese transport system permease protein  34.84 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2782  ABC-3 protein  35.86 
 
 		 466 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  29.14 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  28.33 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  31.66 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  28.49 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  24.7 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  28.49 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  28.09 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>