19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2076 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2123  hypothetical protein  92.42 
 
 
211 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000011259  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  82.46 
 
 
201 aa  343  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  37.71 
 
 
177 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  35.96 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  35.96 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  36.36 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  30.87 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  34.97 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  30.07 
 
 
144 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  29.41 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  26.67 
 
 
142 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4512  hypothetical protein  24.48 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216446  normal  0.847002 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1286  hypothetical protein  27.46 
 
 
145 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2114  hypothetical protein  27.46 
 
 
145 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0658  Mu-like prophage protein GP16  27.03 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0202  hypothetical protein  32.18 
 
 
133 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3375  protein of unknown function DUF1018  24.83 
 
 
233 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>