49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1287 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1287  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  351  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0738123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1321  hypothetical protein  97.63 
 
 
169 aa  343  6e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.239376  hitchhiker  0.00361617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3067  hypothetical protein  93.49 
 
 
164 aa  325  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110363  hitchhiker  6.75932e-09 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1243  hypothetical protein  86.39 
 
 
164 aa  292  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624627  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3053  hypothetical protein  52.99 
 
 
151 aa  138  4e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1087  hypothetical protein  33.1 
 
 
157 aa  83.6  1e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1297  hypothetical protein  36.23 
 
 
168 aa  82.8  2e-15  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05215  hypothetical protein  49.35 
 
 
150 aa  81.3  6e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3951  hypothetical protein  43.48 
 
 
143 aa  80.9  7e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3918  hypothetical protein  36.89 
 
 
146 aa  80.9  8e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4032  hypothetical protein  36.89 
 
 
146 aa  80.9  8e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188724  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1042  hypothetical protein  38.6 
 
 
156 aa  80.5  9e-15  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0670171  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2825  hypothetical protein  36.23 
 
 
145 aa  79  3e-14  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3039  hypothetical protein  33.62 
 
 
139 aa  77  1e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.112157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2584  hypothetical protein  33.87 
 
 
155 aa  76.6  2e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5639  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4915  hypothetical protein  35.29 
 
 
135 aa  75.9  2e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226348  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1319  hypothetical protein  35.21 
 
 
152 aa  76.6  2e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.271113  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2599  hypothetical protein  32 
 
 
170 aa  75.9  3e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08966  hypothetical protein  33.81 
 
 
138 aa  75.5  3e-13  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0342  Protein of unknown function DUF2141  36.67 
 
 
149 aa  73.9  9e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  1.03286e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4785  hypothetical protein  32.12 
 
 
153 aa  73.6  1e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719029  normal  0.162174 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1327  hypothetical protein  31.29 
 
 
162 aa  73.9  1e-12  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1194  Protein of unknown function DUF2141  37.19 
 
 
144 aa  73.2  2e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1550  hypothetical protein  34.86 
 
 
157 aa  70.5  1e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  5.69387e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4023  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  69.3  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.792226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2632  hypothetical protein  35 
 
 
142 aa  69.3  3e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.27751e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1620  hypothetical protein  31.06 
 
 
171 aa  69.3  3e-11  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5198  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  66.6  1e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1202  hypothetical protein  30.08 
 
 
172 aa  67.4  1e-10  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0422688 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1117  hypothetical protein  49.15 
 
 
179 aa  66.2  2e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  6.88301e-10  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0350  hypothetical protein  29.66 
 
 
152 aa  63.9  9e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0357  hypothetical protein  29.66 
 
 
152 aa  63.9  9e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.516954  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3923  hypothetical protein  31.15 
 
 
155 aa  64.3  9e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1595  hypothetical protein  30.65 
 
 
170 aa  63.9  1e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619778  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3749  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  62.8  2e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5428  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  63.2  2e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3440  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  62.4  3e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  0.118261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1896  hypothetical protein  27.54 
 
 
151 aa  62  4e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000720474  hitchhiker  0.000884607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3527  hypothetical protein  28.86 
 
 
151 aa  61.6  5e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3137  hypothetical protein  33.05 
 
 
129 aa  61.2  6e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5037  hypothetical protein  32.11 
 
 
155 aa  60.1  1e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1469  hypothetical protein  26.89 
 
 
171 aa  60.1  1e-08  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3636  hypothetical protein  34.86 
 
 
142 aa  58.5  4e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.0373236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5466  Protein of unknown function DUF2141  28.95 
 
 
156 aa  56.2  2e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1661  hypothetical protein  27.05 
 
 
142 aa  53.5  1e-06  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  2.3194e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0235  hypothetical protein  34.72 
 
 
145 aa  51.6  5e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3889  hypothetical protein  30.89 
 
 
150 aa  50.4  1e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0103  hypothetical protein  25.98 
 
 
164 aa  47.8  8e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2175  hypothetical protein  29.91 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>