49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2632 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2632  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  283  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527751  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1327  hypothetical protein  41.54 
 
 
162 aa  97.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1042  hypothetical protein  33.61 
 
 
156 aa  93.6  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0670171  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1087  hypothetical protein  37.1 
 
 
157 aa  90.9  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1297  hypothetical protein  35.43 
 
 
168 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05215  hypothetical protein  44.07 
 
 
150 aa  84  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1595  hypothetical protein  30.77 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4915  hypothetical protein  31.78 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226348  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1319  hypothetical protein  32.28 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.271113  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3889  hypothetical protein  38.18 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0357  hypothetical protein  29.1 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.516954  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0350  hypothetical protein  29.1 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1550  hypothetical protein  33.96 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000569387  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2584  hypothetical protein  35.04 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5639  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1202  hypothetical protein  29.66 
 
 
172 aa  73.6  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0422688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4023  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.792226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3067  hypothetical protein  33.58 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110363  hitchhiker  0.00000000675932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4785  hypothetical protein  31.78 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719029  normal  0.162174 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1117  hypothetical protein  33.98 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688301  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1243  hypothetical protein  33.88 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624627  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1287  hypothetical protein  35 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0738123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3527  hypothetical protein  29.66 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4032  hypothetical protein  40.37 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188724  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3918  hypothetical protein  40.37 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2825  hypothetical protein  36.7 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1469  hypothetical protein  26.89 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1620  hypothetical protein  30.83 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1321  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.239376  hitchhiker  0.00361617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3951  hypothetical protein  42.31 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1661  hypothetical protein  32.76 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000023194  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5428  hypothetical protein  34.96 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1194  Protein of unknown function DUF2141  28.23 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1896  hypothetical protein  31.19 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000720474  hitchhiker  0.000884607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3053  hypothetical protein  34.82 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3636  hypothetical protein  39.83 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.0373236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3039  hypothetical protein  40.3 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.112157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5466  Protein of unknown function DUF2141  38.89 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3749  hypothetical protein  36.69 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08966  hypothetical protein  27.54 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0342  Protein of unknown function DUF2141  36.45 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103286  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3440  hypothetical protein  37.1 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  0.118261 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3137  hypothetical protein  30.84 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5198  hypothetical protein  34.4 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0235  hypothetical protein  33.98 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3923  hypothetical protein  25.6 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5037  hypothetical protein  46.77 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2599  hypothetical protein  29.84 
 
 
170 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0103  hypothetical protein  28 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2175  hypothetical protein  29.03 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>