26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2175 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2175  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  320  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3904  hypothetical protein  38.89 
 
 		 186 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0783723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1813  hypothetical protein  32.84 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817906 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5428  hypothetical protein  29.13 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1469  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1087  hypothetical protein  29.45 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1595  hypothetical protein  31.75 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619778  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1117  hypothetical protein  30.71 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688301  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2599  hypothetical protein  28.33 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1896  hypothetical protein  30.83 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000720474  hitchhiker  0.000884607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2584  hypothetical protein  40.3 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4785  hypothetical protein  29.46 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719029  normal  0.162174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4023  hypothetical protein  28.23 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.792226 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1297  hypothetical protein  35.29 
 
 		 168 aa  47.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0103  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1319  hypothetical protein  33.82 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.271113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1550  hypothetical protein  30.4 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000569387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1321  hypothetical protein  29.33 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.239376  hitchhiker  0.00361617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1287  hypothetical protein  29.33 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0738123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3067  hypothetical protein  29.14 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110363  hitchhiker  0.00000000675932 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1042  hypothetical protein  36.76 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0670171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2632  hypothetical protein  29.03 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1194  Protein of unknown function DUF2141  31.67 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1243  hypothetical protein  29.91 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1202  hypothetical protein  32.35 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0422688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>