49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1202 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1202  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  355  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0422688 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1087  hypothetical protein  48.57 
 
 
157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1469  hypothetical protein  41.71 
 
 
171 aa  151  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1297  hypothetical protein  43.07 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1117  hypothetical protein  45.08 
 
 
179 aa  132  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688301  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1042  hypothetical protein  42.45 
 
 
156 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0670171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1550  hypothetical protein  46.83 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000569387  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1319  hypothetical protein  38.21 
 
 
152 aa  101  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.271113  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4023  hypothetical protein  36.67 
 
 
151 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.792226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1620  hypothetical protein  30.82 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1896  hypothetical protein  32.7 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000720474  hitchhiker  0.000884607 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0357  hypothetical protein  34.19 
 
 
152 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.516954  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0350  hypothetical protein  34.19 
 
 
152 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4785  hypothetical protein  38.24 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719029  normal  0.162174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3527  hypothetical protein  32.77 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2584  hypothetical protein  32.54 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5639  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1595  hypothetical protein  30.18 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4915  hypothetical protein  33.64 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226348  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3137  hypothetical protein  38.33 
 
 
129 aa  77  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817906 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0235  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2825  hypothetical protein  35.9 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3923  hypothetical protein  32.54 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2632  hypothetical protein  29.66 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527751  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3053  hypothetical protein  32.77 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08966  hypothetical protein  37.01 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520558  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5428  hypothetical protein  32.61 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1194  Protein of unknown function DUF2141  31.93 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1321  hypothetical protein  30.97 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.239376  hitchhiker  0.00361617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3067  hypothetical protein  30.63 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110363  hitchhiker  0.00000000675932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1287  hypothetical protein  30.08 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0738123  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2599  hypothetical protein  27.64 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1243  hypothetical protein  30.63 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624627  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3039  hypothetical protein  30.25 
 
 
139 aa  61.6  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.112157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3889  hypothetical protein  31.91 
 
 
150 aa  58.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1327  hypothetical protein  25.45 
 
 
162 aa  54.7  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3918  hypothetical protein  26.85 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4032  hypothetical protein  26.85 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188724  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0103  hypothetical protein  27.91 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0342  Protein of unknown function DUF2141  35.19 
 
 
149 aa  48.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103286  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05215  hypothetical protein  25.49 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5037  hypothetical protein  32.26 
 
 
155 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3749  hypothetical protein  29.58 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3951  hypothetical protein  31.25 
 
 
143 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1661  hypothetical protein  25.49 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000023194  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3440  hypothetical protein  29.58 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  0.118261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5466  Protein of unknown function DUF2141  32.71 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1813  hypothetical protein  25.78 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2175  hypothetical protein  32.35 
 
 
157 aa  41.2  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5198  hypothetical protein  26.39 
 
 
148 aa  40.8  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.169893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>