50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1087 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1087  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  324  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1297  hypothetical protein  63.2 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1117  hypothetical protein  58.06 
 
 		 179 aa  156  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688301  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1550  hypothetical protein  55.64 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000569387  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1202  hypothetical protein  48.57 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0422688 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1042  hypothetical protein  45.22 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0670171  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1469  hypothetical protein  50.4 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4023  hypothetical protein  38.97 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.792226 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1319  hypothetical protein  42.4 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.271113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0357  hypothetical protein  38.98 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.516954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0350  hypothetical protein  38.98 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2584  hypothetical protein  35.48 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4785  hypothetical protein  35.86 
 
 		 153 aa  97.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719029  normal  0.162174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3527  hypothetical protein  38.02 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2632  hypothetical protein  37.1 
 
 		 142 aa  90.9  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3923  hypothetical protein  38.02 
 
 		 155 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1321  hypothetical protein  34.51 
 
 		 169 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.239376  hitchhiker  0.00361617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1595  hypothetical protein  31.3 
 
 		 170 aa  87  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1620  hypothetical protein  31.76 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1243  hypothetical protein  36.07 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624627  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3067  hypothetical protein  34.38 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110363  hitchhiker  0.00000000675932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1287  hypothetical protein  33.1 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0738123  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4915  hypothetical protein  37.82 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226348  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3137  hypothetical protein  41.6 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2825  hypothetical protein  33.88 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1896  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000720474  hitchhiker  0.000884607 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1327  hypothetical protein  31.45 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3053  hypothetical protein  32.14 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0235  hypothetical protein  33.61 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2599  hypothetical protein  29.6 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1194  Protein of unknown function DUF2141  33.61 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5428  hypothetical protein  30.37 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3039  hypothetical protein  31.93 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4032  hypothetical protein  29.27 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3918  hypothetical protein  29.27 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08966  hypothetical protein  31.58 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0342  Protein of unknown function DUF2141  31.03 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0103  hypothetical protein  26.76 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3889  hypothetical protein  32.69 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5037  hypothetical protein  38.24 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5466  Protein of unknown function DUF2141  38.39 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05215  hypothetical protein  26.27 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3749  hypothetical protein  30.86 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5198  hypothetical protein  36.23 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3440  hypothetical protein  30.86 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  0.118261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3636  hypothetical protein  34.52 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.0373236 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2175  hypothetical protein  38.24 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3951  hypothetical protein  28.89 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1661  hypothetical protein  29.92 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000023194  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1813  hypothetical protein  25.74 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>