39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0103 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0103  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  335  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5428  hypothetical protein  43.08 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2584  hypothetical protein  31.54 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5639  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4023  hypothetical protein  29.37 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.792226 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1087  hypothetical protein  26.49 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1194  Protein of unknown function DUF2141  34.17 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1620  hypothetical protein  29.93 
 
 
171 aa  57.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3137  hypothetical protein  31.67 
 
 
129 aa  57.4  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3923  hypothetical protein  30.71 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1202  hypothetical protein  26.95 
 
 
172 aa  54.3  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0422688 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1117  hypothetical protein  26.45 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688301  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1469  hypothetical protein  28.93 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1042  hypothetical protein  25.97 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0670171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1297  hypothetical protein  25.74 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5198  hypothetical protein  30.83 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0235  hypothetical protein  31.53 
 
 
145 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4785  hypothetical protein  31.62 
 
 
153 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719029  normal  0.162174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2599  hypothetical protein  31.45 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3749  hypothetical protein  30.19 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1287  hypothetical protein  25.98 
 
 
169 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0738123  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1319  hypothetical protein  26.71 
 
 
152 aa  48.5  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.271113  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4915  hypothetical protein  28.1 
 
 
135 aa  48.5  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1243  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1321  hypothetical protein  25.98 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.239376  hitchhiker  0.00361617 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1550  hypothetical protein  29.92 
 
 
157 aa  47.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000569387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3067  hypothetical protein  25.98 
 
 
164 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110363  hitchhiker  0.00000000675932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3440  hypothetical protein  29.46 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  0.118261 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1595  hypothetical protein  25.95 
 
 
170 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619778  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2175  hypothetical protein  27.27 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0357  hypothetical protein  27.5 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.516954  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0350  hypothetical protein  27.5 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1813  hypothetical protein  29.09 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5037  hypothetical protein  29.66 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2632  hypothetical protein  28 
 
 
142 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527751  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3527  hypothetical protein  24.7 
 
 
151 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3904  hypothetical protein  33.64 
 
 
186 aa  44.3  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0783723  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1896  hypothetical protein  25.47 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000720474  hitchhiker  0.000884607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3636  hypothetical protein  28.69 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.0373236 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3053  hypothetical protein  22.66 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>