47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0512 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 		 176 aa  338  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  47.9 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.95 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.56 
 
 		 171 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2716  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.7 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.653376  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2811  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.1 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2630  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  49.7 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.73 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.52 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.95 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.71 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.57 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  35.4 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.36 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  29.87 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  28.93 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  29.45 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.56 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.78 
 
 		 354 aa  54.3  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.23 
 
 		 371 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.83 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32 
 
 		 133 aa  52  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.45 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  26.16 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.33 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  32.65 
 
 		 408 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.93 
 
 		 462 aa  46.6  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  44 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.27 
 
 		 352 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1576  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.83 
 
 		 373 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  38.27 
 
 		 344 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.52 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  27.61 
 
 		 359 aa  44.7  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.71 
 
 		 330 aa  43.9  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.23 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.1 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.46 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.74 
 
 		 368 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  31.43 
 
 		 402 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  23.5 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  31.43 
 
 		 402 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  31.43 
 
 		 402 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  30.61 
 
 		 408 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  31.58 
 
 		 405 aa  42.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.47 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.32 
 
 		 407 aa  41.6  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  28 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>