More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2158 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 224 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  66.22 
 
 		 226 aa  337  7e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  65.02 
 
 		 229 aa  329  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2975  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.83 
 
 		 234 aa  280  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0981  glutathione S-transferase domain-containing protein  60 
 
 		 236 aa  278  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0387  glutathione S-transferase-like  57.85 
 
 		 229 aa  278  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  59.64 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5156  Glutathione S-transferase domain  59.74 
 
 		 234 aa  275  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561496  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2345  glutathione S-transferase, putative  57.4 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3374  putative glutathione S-transferase  57.4 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0444471  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3417  glutathione S-transferase, putative  57.4 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0270497  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2523  putative glutathione S-transferase  57.4 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0257  putative glutathione S-transferase  57.4 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1119  putative glutathione S-transferase  57.4 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3410  putative glutathione S-transferase  57.4 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1690  Glutathione S-transferase domain  56.71 
 
 		 231 aa  264  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5179  glutathione S-transferase-like  53.36 
 
 		 231 aa  261  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0776734  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6162  Glutathione S-transferase domain  56.89 
 
 		 227 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5133  Glutathione S-transferase domain  55.65 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3226  glutathione S-transferase-like  56.02 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.74059  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2604  glutathione S-transferase  55.81 
 
 		 227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.918843  normal  0.211055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.05 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1831  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.84 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  44.1 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  47.32 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  46.57 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.99 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  40.89 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  42.17 
 
 		 232 aa  174  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.04 
 
 		 231 aa  174  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.61 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  42.42 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  42.04 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.05 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.42 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  44.98 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  44.61 
 
 		 233 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  43.86 
 
 		 229 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  45.59 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  42.61 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.99 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  42.73 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  43.11 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  44.08 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  38.94 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  43.27 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  40 
 
 		 239 aa  168  8e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  42.11 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  39.82 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  41.92 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  41.67 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  41.95 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.22 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  42.38 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.78 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  44.12 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  45.59 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  45.59 
 
 		 215 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.32 
 
 		 237 aa  164  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  41.63 
 
 		 235 aa  164  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.54 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  42.54 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4163  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.69 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  41.67 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  44.71 
 
 		 230 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  44.66 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2851  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.63 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0434229  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  39.3 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  38.43 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.58 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02227  predicted glutathione S-transferase  45.1 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0437248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2452  glutathione S-transferase  45.1 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1354  Glutathione S-transferase domain protein  45.1 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000942555  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1350  glutathione S-transferase  45.1 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0219801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2596  glutathione S-transferase  45.1 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000860005  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.33 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02187  hypothetical protein  45.1 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0695509  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2678  glutathione S-transferase  45.1 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000401347  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  45.19 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  40.35 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  44.61 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.23 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  44.61 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  40.93 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  44.61 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  44.61 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.79 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.79 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  41.35 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  44.12 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  40.35 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  43.41 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.36 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3373  putative glutathione S-transferase  39.13 
 
 		 232 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3416  putative glutathione S-transferase-like protein  39.13 
 
 		 232 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3409  putative glutathione S-transferase  39.13 
 
 		 232 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0258  putative glutathione S-transferase  39.13 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2524  putative glutathione S-transferase  39.13 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1120  putative glutathione S-transferase  39.13 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  40.35 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>