55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3645 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3645  sulfur transfer complex subunit TusB  100 
 
 
95 aa  194  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  5.89995e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3646  sulfur transfer complex subunit TusB  100 
 
 
95 aa  194  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.08756e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3754  sulfur transfer complex subunit TusB  98.95 
 
 
95 aa  193  8e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0063363  normal  0.0472273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3719  sulfur transfer complex subunit TusB  98.95 
 
 
95 aa  193  8e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  4.0872e-06  normal  0.0520484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3817  sulfur transfer complex subunit TusB  97.89 
 
 
95 aa  191  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  7.02731e-05  normal  0.989859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3539  sulfur transfer complex subunit TusB  68.42 
 
 
95 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.07691e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3717  sulfur transfer complex subunit TusB  68.42 
 
 
95 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.4476e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3812  sulfur transfer complex subunit TusB  68.42 
 
 
95 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.71307e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03145  hypothetical protein  68.42 
 
 
95 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.56644e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03194  predicted intracellular sulfur oxidation protein  68.42 
 
 
95 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.36461e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4652  sulfur transfer complex subunit TusB  68.42 
 
 
95 aa  134  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  2.3417e-09  normal  0.021154 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0370  sulfur relay protein TusB/DsrH  68.42 
 
 
95 aa  134  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.94824e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0370  sulfur transfer complex subunit TusB  67.37 
 
 
95 aa  132  1e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.50284e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3624  sulfur transfer complex subunit TusB  65.26 
 
 
95 aa  127  4e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  3.15434e-09  hitchhiker  0.000889218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3760  sulfur transfer complex subunit TusB  57.89 
 
 
95 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  8.01826e-07  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0315  sulfur relay protein TusB/DsrH  52.63 
 
 
95 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000131562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0397  sulfur relay protein TusB/DsrH  53.68 
 
 
95 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  2.47543e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4552  sulfur transfer complex subunit TusB  49.47 
 
 
95 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.46848e-08  normal  0.147371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3831  sulfur relay protein TusB/DsrH  48.42 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4011  sulfur relay protein TusB/DsrH  46.32 
 
 
95 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000192762  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0274  sulfur transfer complex subunit TusB  44.21 
 
 
95 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000269868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3679  sulfur transfer complex subunit TusB  44.21 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.4763e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3922  sulfur transfer complex subunit TusB  44.21 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.20645e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0491  sulfur transfer complex subunit TusB  41.05 
 
 
95 aa  77.4  7e-14  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.870236  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0035  sulfur relay protein TusB/DsrH  39 
 
 
97 aa  61.6  3e-09  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00058  hypothetical protein  36.84 
 
 
91 aa  58.2  4e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  39.36 
 
 
97 aa  57.8  6e-08  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  39.77 
 
 
97 aa  56.2  1e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  5.63388e-05  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2481  DsrH protein  36.73 
 
 
99 aa  56.6  1e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1965  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  40.21 
 
 
99 aa  51.6  3e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0134  DsrH family protein  38.64 
 
 
97 aa  52  3e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00043522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1923  hypothetical protein  34.38 
 
 
96 aa  49.3  2e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.597175  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  36.36 
 
 
99 aa  48.5  3e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  35.11 
 
 
97 aa  48.9  3e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3577  DsrH like protein  32.63 
 
 
97 aa  48.9  3e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2189  sulfur relay protein TusB/DsrH  41.1 
 
 
100 aa  47.8  5e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.62558  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1955  DsrH family protein  36.27 
 
 
99 aa  47.4  6e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.392226  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3441  intracellular sulfur oxidation protein of DsrH family protein  33.75 
 
 
96 aa  47.4  7e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  hitchhiker  0.000104159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  34.02 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  34.02 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  35.48 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  35.37 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  35.05 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28140  dissimilatory sulfite reductase, DsrH-like protein  34.38 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002296  hypothetical protein  44.19 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.39536e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  35.29 
 
 
101 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2315  sulfur relay protein TusB/DsrH  31.91 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2378  hypothetical protein  34.62 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1521  hypothetical protein  26.6 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389974  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0309  hypothetical protein  31.17 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00407808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0514  sulfur relay protein TusB/DsrH  37.84 
 
 
92 aa  40.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00166846  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2006  DsrH family protein  33.33 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.039715  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1970  DsrH family protein  33.33 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.81262e-05  normal  0.848273 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2770  hypothetical protein  29.47 
 
 
91 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.17005e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.93 
 
 
93 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  6.56489e-05  hitchhiker  9.66631e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>