299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0664 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0599  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0602  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.921994  normal  0.0915325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0600  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.775158  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0606  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0764025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0664  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.294078  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  6.20516e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0241  tRNA-Arg  96.1 
 
 
79 bp  129  1e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.628692  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00007  tRNA-Arg  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0582  tRNA-Arg  96.1 
 
 
79 bp  129  1e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  2.47527e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0081  tRNA-Arg  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0638  tRNA-Arg  96.1 
 
 
79 bp  129  1e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.737204  normal  0.415915 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0067  tRNA-Arg  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4647  tRNA-Arg  96.1 
 
 
79 bp  129  1e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.695666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5013  tRNA-Arg  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0046  tRNA-Arg  96.05 
 
 
77 bp  127  4e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0052  tRNA-Arg  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280732  normal  0.142339 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0055  tRNA-Arg  95.83 
 
 
77 bp  119  1e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0044  tRNA-Arg  95.83 
 
 
77 bp  119  1e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  95.83 
 
 
77 bp  119  1e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  96.97 
 
 
77 bp  115  2e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  7.75321e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0037  tRNA-Arg  94.44 
 
 
77 bp  111  2e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3789  tRNA-Arg  93.15 
 
 
77 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0038  tRNA-Arg  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00706583  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0040  tRNA-Arg  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435782  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0040  tRNA-Arg  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849707  normal  0.98393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4261  tRNA-Arg  93.06 
 
 
79 bp  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000175716  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0061  tRNA-Arg  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.204064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0040  tRNA-Arg  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0042  tRNA-Arg  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155325  normal  0.0810865 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0025  tRNA-Arg  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0135178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1282  tRNA-Arg  93.06 
 
 
79 bp  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.13688e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0040  tRNA-Arg  93.06 
 
 
77 bp  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0048  tRNA-Arg  92.96 
 
 
74 bp  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0059  tRNA-Arg  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0019  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0029  tRNA-Arg  93.85 
 
 
74 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.179908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt24  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt24  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309097  tRNA-Arg  93.85 
 
 
74 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0924  tRNA-Arg  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1545  tRNA-Arg  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1514  tRNA-Arg  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1748  tRNA-Arg  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0337298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0024  tRNA-Arg  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2749  tRNA-Arg  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1714  tRNA-Arg  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t09  tRNA-Arg  94.92 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  94.92 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0682  tRNA-Arg  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.868676  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0787  tRNA-Arg  90.54 
 
 
79 bp  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.506305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0012  tRNA-Arg  91.3 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.255284 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309170  tRNA-Arg  92.31 
 
 
74 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.269731  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0047  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  3.57369e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0007  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.173702  normal  0.696884 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0113  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.84792e-07  normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0017  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.915469  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  93.44 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.83529e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0039  tRNA-Arg  90.28 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  9.65131e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0027  tRNA-Arg  90.28 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.23271e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0116  tRNA-Arg  90.28 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.99679e-09  normal  0.0138295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0116  tRNA-Arg  90.28 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.04257e-07  normal  0.0490719 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0049  tRNA-Arg  90.28 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  8.22334e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0028  tRNA-Arg  90.28 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.31563e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t096  tRNA-Arg  90.28 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  7.47728e-11  normal  0.0921402 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0086  tRNA-Arg  90.28 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.21106e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0065  tRNA-Arg  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  6.31385e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t025  tRNA-Arg  90.28 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309379  tRNA-Arg  93.22 
 
 
74 bp  85.7  1e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0734599  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  92.06 
 
 
74 bp  85.7  1e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg04  tRNA-Arg  92.06 
 
 
80 bp  85.7  1e-15  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364203  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0012  tRNA-Arg  91.04 
 
 
74 bp  85.7  1e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0409907  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0018  tRNA-Arg  93.22 
 
 
77 bp  85.7  1e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309268  tRNA-Arg  91.04 
 
 
74 bp  85.7  1e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.292305 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  92.06 
 
 
74 bp  85.7  1e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  92.06 
 
 
74 bp  85.7  1e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309209  tRNA-Arg  91.04 
 
 
74 bp  85.7  1e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  83.8  5e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  7.05596e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0057  tRNA-Arg  89.19 
 
 
77 bp  83.8  5e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0026  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  83.8  5e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.98043e-14  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0086  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  83.8  5e-15  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  4.50897e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2138  tRNA-Arg  93.1 
 
 
79 bp  83.8  5e-15  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0224464  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  83.8  5e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2213  tRNA-Arg  93.1 
 
 
79 bp  83.8  5e-15  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.140545  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0029  tRNA-Arg  93.1 
 
 
77 bp  83.8  5e-15  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0041  tRNA-Arg  94.34 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000701691  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.71008e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  92.98 
 
 
74 bp  81.8  2e-14  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0050  tRNA-Arg  94.34 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0007  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.688543  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0036  tRNA-Arg  89.04 
 
 
74 bp  81.8  2e-14  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.49468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2235  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.78277e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  3.59807e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0033  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0041  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0106412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>