28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4039 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0014  conserved hypothetical protein  78.68 
 
 
404 aa  668    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03572  hypothetical protein  79.66 
 
 
404 aa  676    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0011  putative ATP/GTP-binding protein  75.25 
 
 
408 aa  646    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551197  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3901  hypothetical protein  79.17 
 
 
404 aa  672    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4198  hypothetical protein  79.66 
 
 
404 aa  676    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03516  hypothetical protein  79.66 
 
 
404 aa  676    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5122  hypothetical protein  77.45 
 
 
416 aa  660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.116872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4201  putative ATP/GTP-binding protein  98.04 
 
 
408 aa  827    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4039  putative cytoplasmic protein  100 
 
 
408 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0014  hypothetical protein  78.68 
 
 
404 aa  668    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4054  hypothetical protein  78.43 
 
 
404 aa  667    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4230  hypothetical protein  76.68 
 
 
356 aa  551  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0046  hypothetical protein  62.95 
 
 
426 aa  537  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0037  hypothetical protein  61.87 
 
 
428 aa  527  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0032  hypothetical protein  61.05 
 
 
434 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0009  hypothetical protein  61.63 
 
 
433 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4109  hypothetical protein  60.77 
 
 
427 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3923  hypothetical protein  59.14 
 
 
427 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4309  hypothetical protein  37.03 
 
 
460 aa  242  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0549386  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  28.93 
 
 
441 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.45 
 
 
673 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  32.43 
 
 
419 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.71 
 
 
660 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  19.95 
 
 
1066 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 
642 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  28.57 
 
 
427 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.02 
 
 
682 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  35.19 
 
 
720 aa  43.1  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>