More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1913 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  100 
 
 		 509 aa  1056    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  61.61 
 
 		 473 aa  591  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  58.97 
 
 		 467 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  59.17 
 
 		 467 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  58.38 
 
 		 467 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  57.99 
 
 		 467 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  58.07 
 
 		 470 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  57.87 
 
 		 470 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  58.07 
 
 		 470 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  58.27 
 
 		 470 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  57.09 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  57.23 
 
 		 469 aa  555  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  57.91 
 
 		 467 aa  547  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  56.16 
 
 		 477 aa  548  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  55.19 
 
 		 490 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  55.09 
 
 		 471 aa  522  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  51.2 
 
 		 497 aa  473  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  49.49 
 
 		 453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  50.72 
 
 		 456 aa  465  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.71 
 
 		 452 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.1 
 
 		 456 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.82 
 
 		 458 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  50.82 
 
 		 458 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  49.32 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  50.5 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  50.82 
 
 		 458 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  50.3 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  50 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  50.3 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  50.1 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.7 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.8 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  50.3 
 
 		 453 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.72 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.7 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.9 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  50 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  50.1 
 
 		 454 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  50.1 
 
 		 454 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  50.1 
 
 		 456 aa  441  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  49.9 
 
 		 454 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  50.1 
 
 		 454 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49.39 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  50.1 
 
 		 454 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.95 
 
 		 474 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.05 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0453  para-aminobenzoate synthase, component I  44.81 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0249447  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.25 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  44.51 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.01 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.59 
 
 		 448 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  42.34 
 
 		 471 aa  363  4e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01948  P-aminobenzoate synthetase, component I  41.5 
 
 		 476 aa  361  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0024318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  41.95 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.78 
 
 		 474 aa  358  9e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.56 
 
 		 466 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  40.76 
 
 		 447 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  39.6 
 
 		 447 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  47.79 
 
 		 408 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.88 
 
 		 446 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.28 
 
 		 447 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  40.7 
 
 		 443 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.48 
 
 		 446 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.41 
 
 		 447 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.2 
 
 		 450 aa  340  5e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.93 
 
 		 461 aa  339  7e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  46.27 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  46.02 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.43 
 
 		 480 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  43.83 
 
 		 495 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.84 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.33 
 
 		 466 aa  311  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.87 
 
 		 509 aa  302  8.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.14 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  38.14 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.59 
 
 		 449 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.5 
 
 		 721 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.85 
 
 		 469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1514  hypothetical protein  40.1 
 
 		 440 aa  281  3e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1469  hypothetical protein  41.41 
 
 		 440 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  35.75 
 
 		 465 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.26 
 
 		 457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5240  para-aminobenzoate synthase, component I  35.7 
 
 		 465 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0064  para-aminobenzoate synthase component I  35.91 
 
 		 465 aa  273  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0077  para-aminobenzoate synthase, component I  35.91 
 
 		 465 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000409192 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  39.74 
 
 		 448 aa  273  7e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0068  para-aminobenzoate synthase component I  35.91 
 
 		 465 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0064  para-aminobenzoate synthase component I  35.91 
 
 		 465 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  35.91 
 
 		 465 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0067  para-aminobenzoate synthase component I  35.91 
 
 		 480 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  35.07 
 
 		 465 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1671  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.11 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  39.49 
 
 		 448 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0080  para-aminobenzoate synthase, component I  35.45 
 
 		 465 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.59 
 
 		 474 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.4 
 
 		 464 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.87 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0076  para-aminobenzoate synthase, component I  34.35 
 
 		 465 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.73 
 
 		 741 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  35.98 
 
 		 496 aa  264  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>