41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1970 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1970  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  722    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0345  putative helix-turn-helix containsing protein  33.15 
 
 
364 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000345136  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1064  putative helix-turn-helix containsing protein  32.09 
 
 
365 aa  178  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000317042  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0015  putative helix-turn-helix containsing protein  32.23 
 
 
353 aa  178  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0431  putative helix-turn-helix containsing protein  30.08 
 
 
368 aa  171  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0284  uncharacterized ATPase  30.92 
 
 
354 aa  159  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00295155  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0056  conserved hypothetical ATP-binding protein  31.3 
 
 
353 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1884  hypothetical protein  29.17 
 
 
345 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1704  hypothetical protein  29.17 
 
 
345 aa  123  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.287149  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1518  hypothetical protein  29.17 
 
 
345 aa  122  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  23.13 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  24.88 
 
 
428 aa  77.4  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  24.32 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  24.11 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  25.38 
 
 
471 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  23.47 
 
 
431 aa  62.4  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  26.02 
 
 
426 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  23.88 
 
 
400 aa  59.7  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  21.59 
 
 
415 aa  59.3  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  23.27 
 
 
427 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  23.79 
 
 
410 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  22.81 
 
 
421 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  25.18 
 
 
423 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  24.45 
 
 
423 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  25.27 
 
 
423 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  22.34 
 
 
403 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  24.56 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  20 
 
 
410 aa  53.9  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  22.74 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  28.36 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  23.88 
 
 
432 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  23.03 
 
 
430 aa  47  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  26.46 
 
 
392 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  23.08 
 
 
429 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  26.46 
 
 
406 aa  46.2  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  20.7 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  20.7 
 
 
424 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  23.74 
 
 
431 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  21.89 
 
 
414 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  24.41 
 
 
462 aa  43.1  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  20.5 
 
 
425 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>