16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1064 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1064  putative helix-turn-helix containsing protein  100 
 
 
365 aa  734    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000317042  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0345  putative helix-turn-helix containsing protein  57.81 
 
 
364 aa  422  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000345136  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0431  putative helix-turn-helix containsing protein  42.55 
 
 
368 aa  272  6e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0015  putative helix-turn-helix containsing protein  40.27 
 
 
353 aa  268  1e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0056  conserved hypothetical ATP-binding protein  37.98 
 
 
353 aa  196  6e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1970  hypothetical protein  32.09 
 
 
357 aa  178  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0284  uncharacterized ATPase  30.75 
 
 
354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00295155  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1518  hypothetical protein  32.42 
 
 
345 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1704  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.287149  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1884  hypothetical protein  33.06 
 
 
345 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  26.67 
 
 
430 aa  53.1  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  25.26 
 
 
427 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  27.98 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  24.76 
 
 
431 aa  46.6  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  22.93 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  23.28 
 
 
427 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>