26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0008 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0008  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  822  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  62.53 
 
 
412 aa  514  1e-144  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  63.14 
 
 
411 aa  514  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  60.44 
 
 
406 aa  506  1e-142  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0015  hypothetical protein  63.5 
 
 
408 aa  494  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.2869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0015  hypothetical protein  63.5 
 
 
408 aa  495  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.83051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0042  hypothetical protein  63.5 
 
 
408 aa  494  1e-138  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.233125  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  61.61 
 
 
408 aa  483  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  54.17 
 
 
405 aa  449  1e-125  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  47.99 
 
 
396 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2075  hydrolase (HAD superfamily)  43.44 
 
 
396 aa  348  9e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.957527  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0050  hypothetical protein  37.14 
 
 
416 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1061  hypothetical protein  37.82 
 
 
413 aa  255  1e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  2.3277e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2605  hypothetical protein  36.87 
 
 
412 aa  253  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000329131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0727  hypothetical protein  35.4 
 
 
413 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190594  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0968  hypothetical protein  36.34 
 
 
423 aa  243  4e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0736  hypothetical protein  36.48 
 
 
413 aa  243  6e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000863321  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1594  hydrolase (HAD superfamily)  34.34 
 
 
396 aa  218  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1299  hypothetical protein  34.44 
 
 
398 aa  209  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.201423  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 
349 aa  81.6  2e-14  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  24.28 
 
 
360 aa  73.2  7e-12  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  24.69 
 
 
359 aa  57.4  4e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  31.53 
 
 
195 aa  54.7  3e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 
205 aa  48.9  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  30.51 
 
 
201 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  25.14 
 
 
201 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>