More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1987 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  99.51 
 
 
205 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.58003e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2360  carbonate dehydratase  100 
 
 
205 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000972016  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1987  Carbonate dehydratase  100 
 
 
205 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.42238e-08  hitchhiker  1.00823e-09 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  99.51 
 
 
205 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.08683e-08  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2126  carbonate dehydratase  97.07 
 
 
205 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  94.42 
 
 
201 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  9.69176e-10 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  94.92 
 
 
201 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  1.07461e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  93.4 
 
 
201 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2474  carbonic anhydrase family protein  92.89 
 
 
201 aa  384  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  85 
 
 
204 aa  363  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  86.14 
 
 
203 aa  362  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  82.32 
 
 
204 aa  357  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  84.85 
 
 
201 aa  355  2e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1859  carbonate dehydratase  82.32 
 
 
203 aa  353  8e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0117896  unclonable  1.51742e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  82.32 
 
 
203 aa  349  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2421  carbonate dehydratase  79.29 
 
 
204 aa  340  8e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.658807  decreased coverage  8.97123e-07 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  66.84 
 
 
206 aa  292  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  67.36 
 
 
210 aa  289  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  64.06 
 
 
217 aa  270  8e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5382  putative carbonic anhydrase  63.45 
 
 
215 aa  269  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61860  putative carbonic anhydrase  63.45 
 
 
215 aa  269  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0165234 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1903  carbonate dehydratase  61.62 
 
 
220 aa  266  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  60.82 
 
 
200 aa  265  3e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1969  carbonate dehydratase  61.11 
 
 
220 aa  265  4e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8834  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0127  Carbonate dehydratase  61.31 
 
 
226 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  60.62 
 
 
387 aa  263  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0277  carbonic anhydrase protein  61.81 
 
 
226 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101994  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2596  Carbonate dehydratase  61.73 
 
 
220 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0135  Carbonate dehydratase  61.31 
 
 
226 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0994  carbonic anhydrase  62.76 
 
 
212 aa  262  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0530644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0859  carbonate dehydratase  62.24 
 
 
212 aa  261  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4773  carbonic anhydrase  60.71 
 
 
214 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.115077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3483  carbonic anhydrase  58.16 
 
 
199 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2030  carbonate dehydratase  61.9 
 
 
221 aa  258  5e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.177526  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1746  Carbonate dehydratase  60.42 
 
 
221 aa  257  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  58.29 
 
 
213 aa  257  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0119  carbonic anhydrase  57.82 
 
 
220 aa  256  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2574  carbonate dehydratase  61.42 
 
 
217 aa  256  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  57.82 
 
 
220 aa  256  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3533  carbonic anhydrase  57.82 
 
 
220 aa  255  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0136  carbonic anhydrase  57.82 
 
 
220 aa  255  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  57.82 
 
 
220 aa  255  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00124  hypothetical protein  57.82 
 
 
220 aa  255  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  57.82 
 
 
220 aa  255  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0128  carbonic anhydrase  57.82 
 
 
220 aa  255  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0130  carbonic anhydrase  57.82 
 
 
220 aa  255  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3369  carbonate dehydratase  58.03 
 
 
223 aa  254  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2395  dihydroorotase homodimeric type  59.69 
 
 
209 aa  254  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.316907  normal  0.063783 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4077  Carbonate dehydratase  59.59 
 
 
215 aa  254  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  59.8 
 
 
380 aa  254  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  59.16 
 
 
210 aa  254  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  56.54 
 
 
196 aa  253  1e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0137  carbonate dehydratase  61.38 
 
 
223 aa  253  2e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1874  carbonate dehydratase  57.87 
 
 
227 aa  253  2e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0390  carbonate dehydratase  58.38 
 
 
209 aa  251  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286988  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0674  carbonic anhydrase  57.71 
 
 
220 aa  251  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  57.22 
 
 
212 aa  250  8e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0456  carbonate dehydratase  60.94 
 
 
219 aa  249  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.162063  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  56.22 
 
 
218 aa  249  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0105  carbonic anhydrase  61.38 
 
 
223 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0190  carbonic anhydrase  57.14 
 
 
220 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.483566 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2616  carbonic anhydrase 2  61.14 
 
 
219 aa  249  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0187  carbonic anhydrase  57.14 
 
 
220 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13235  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0186  carbonic anhydrase  57.14 
 
 
220 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316931  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0203  carbonic anhydrase  57.14 
 
 
220 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0195  carbonic anhydrase  57.14 
 
 
220 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  56.19 
 
 
310 aa  248  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1332  carbonate dehydratase  57.07 
 
 
223 aa  247  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.547264  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  56.19 
 
 
291 aa  247  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  55.9 
 
 
220 aa  247  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  54.73 
 
 
213 aa  247  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5990  carbonate dehydratase  57 
 
 
220 aa  246  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.72555e-05 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3056  Carbonate dehydratase  58.67 
 
 
220 aa  246  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  54.73 
 
 
211 aa  246  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4254  putative carbonic anhydrase  61.31 
 
 
258 aa  246  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  54.73 
 
 
213 aa  247  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3778  carbonate dehydratase  58.97 
 
 
220 aa  247  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4203  carbonate dehydratase  57.07 
 
 
220 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.88965e-05 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  57.07 
 
 
215 aa  245  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0118  putative carbonic anhydrase  58.03 
 
 
222 aa  244  5e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002555  carbonic anhydrase  58.55 
 
 
222 aa  244  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.997557  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2056  carbonate dehydratase  55.45 
 
 
213 aa  243  1e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106365  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00754  carbonic anhydrase  60.19 
 
 
220 aa  243  1e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.226813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0462  Carbonate dehydratase  58.79 
 
 
258 aa  243  2e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3841  carbonate dehydratase  57.29 
 
 
223 aa  243  2e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4370  carbonate dehydratase  55.9 
 
 
220 aa  241  4e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4734  Carbonate dehydratase  56.48 
 
 
255 aa  241  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  55.44 
 
 
223 aa  241  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0179  carbonate dehydratase  59.28 
 
 
258 aa  240  8e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.420531  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03457  carbonic anhydrase  57.51 
 
 
222 aa  240  9e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2927  carbonate dehydratase  60.31 
 
 
255 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2942  carbonate dehydratase  60.31 
 
 
255 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2313  carbonate dehydratase  60.31 
 
 
255 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2839  carbonate dehydratase  60.31 
 
 
256 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.66431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4189  carbonate dehydratase  55.96 
 
 
233 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2976  carbonate dehydratase  60.31 
 
 
256 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0378  carbonate dehydratase  60.31 
 
 
261 aa  239  3e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  0.578171 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0840  carbonic anhydrase  53.73 
 
 
230 aa  238  5e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0252218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0345  beta carbonic anhydrase  58.5 
 
 
250 aa  237  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0397  carbonic anhydrase  58 
 
 
256 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>