More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0036 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0036  transposase family  100 
 
 
410 aa  837    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  91.28 
 
 
523 aa  731    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  91.28 
 
 
523 aa  731    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  90.58 
 
 
524 aa  720    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  91.28 
 
 
523 aa  731    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  91.28 
 
 
523 aa  731    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  91.28 
 
 
523 aa  731    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  91.28 
 
 
523 aa  731    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  52.77 
 
 
533 aa  428  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1606  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  52.06 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  51.57 
 
 
512 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  51.82 
 
 
512 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  51.82 
 
 
512 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  52.76 
 
 
512 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  52.76 
 
 
512 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  52.76 
 
 
512 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  52.76 
 
 
512 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  52.76 
 
 
512 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  52.76 
 
 
512 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  52.76 
 
 
512 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  52.76 
 
 
512 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  52.76 
 
 
512 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  52.49 
 
 
512 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  52.65 
 
 
512 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  52.49 
 
 
512 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  52.49 
 
 
512 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  52.65 
 
 
512 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  52.49 
 
 
512 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  52.49 
 
 
512 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  52.49 
 
 
512 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  52.49 
 
 
512 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  52.49 
 
 
512 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  50.52 
 
 
523 aa  359  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  50.26 
 
 
523 aa  359  6e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  50.26 
 
 
523 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  50.26 
 
 
523 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  50.26 
 
 
523 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  50.26 
 
 
523 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  50.26 
 
 
523 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  46.81 
 
 
520 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0023  IS66 family element, transposase  50 
 
 
530 aa  354  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0065  IS66 family element, transposase  50 
 
 
530 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.116785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3899  IS66 family element, transposase  50 
 
 
530 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1847  IS66 family element, transposase  50 
 
 
530 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2143  IS66 family element, transposase  50 
 
 
517 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4623  IS66 family element, transposase  50 
 
 
530 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2961  IS66 family element, transposase  50 
 
 
530 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.834706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1284  IS66 family element, transposase  50 
 
 
530 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0906  IS66 family element, transposase  49.73 
 
 
530 aa  353  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0847  IS66 family element, transposase  49.73 
 
 
530 aa  353  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0255  IS66 family element, transposase  49.73 
 
 
530 aa  353  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2123  IS66 family transposase  46.28 
 
 
537 aa  352  5e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1339  IS66 family element, transposase  50 
 
 
537 aa  350  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  47.45 
 
 
532 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  46.79 
 
 
531 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  44.44 
 
 
516 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  48.7 
 
 
508 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  47.01 
 
 
531 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0015  transposase and inactivated derivatives  93.06 
 
 
183 aa  320  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  44.69 
 
 
524 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  45.78 
 
 
491 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  44.44 
 
 
522 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4656  Aec53  82.99 
 
 
303 aa  298  8e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204904  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  38 
 
 
537 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  39.01 
 
 
505 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  39.01 
 
 
505 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  39.01 
 
 
505 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  40.05 
 
 
556 aa  252  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>