35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1315 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1315  transcriptional repressor CodY  100 
 
 
257 aa  511  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.8867e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1340  transcriptional repressor CodY  100 
 
 
257 aa  511  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  5.48296e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0821  transcriptional repressor CodY  93.73 
 
 
256 aa  476  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298732  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1107  transcriptional repressor CodY  64.59 
 
 
259 aa  320  1e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.55926e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1317  transcriptional repressor CodY  63.42 
 
 
259 aa  318  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  6.04524e-10  hitchhiker  6.27624e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3926  transcriptional repressor CodY  63.42 
 
 
259 aa  318  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.52017e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1999  transcriptional repressor CodY  64.2 
 
 
259 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3875  transcriptional repressor CodY  63.04 
 
 
259 aa  316  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.3796e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3679  transcriptional repressor CodY  63.04 
 
 
259 aa  316  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  5.00442e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3966  transcriptional repressor CodY  63.04 
 
 
259 aa  316  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.07979e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3587  transcriptional repressor CodY  63.04 
 
 
259 aa  316  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.52873e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3569  transcriptional repressor CodY  63.04 
 
 
259 aa  316  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.96382e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3840  transcriptional repressor CodY  63.04 
 
 
259 aa  316  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.06585e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2480  transcriptional repressor CodY  63.42 
 
 
259 aa  315  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.57374e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3869  transcriptional repressor CodY  62.65 
 
 
259 aa  314  8e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  7.36114e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3651  transcriptional repressor CodY  63.42 
 
 
259 aa  314  1e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  5.06511e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07580  transcriptional repressor CodY  56.08 
 
 
260 aa  278  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.62379e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1228  transcriptional repressor CodY  52.53 
 
 
261 aa  271  6e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.44432e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1673  transcriptional repressor CodY  52.92 
 
 
258 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000117412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1955  transcriptional repressor CodY  52.92 
 
 
258 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00079706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3711  transcriptional repressor CodY  55.47 
 
 
262 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.207426  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1386  transcriptional repressor CodY  53.67 
 
 
261 aa  253  2e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.2677e-09  normal  0.893187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1031  transcriptional repressor CodY  49.41 
 
 
262 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  4.37393e-13  unclonable  9.3058e-09 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1697  transcriptional repressor CodY  52.73 
 
 
250 aa  244  1e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00224201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0605  transcriptional repressor CodY  47.45 
 
 
259 aa  243  2e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  2.44841e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1979  transcriptional repressor CodY  48.25 
 
 
261 aa  241  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  2.33439e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1675  transcriptional repressor CodY  44.06 
 
 
261 aa  219  3e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0845  transcriptional repressor CodY  47.06 
 
 
262 aa  219  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1341  GTP-sensing pleiotropic transcriptional repressor CodY  45.45 
 
 
276 aa  215  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000508255  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1599  transcriptional repressor CodY  44.44 
 
 
261 aa  215  7e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00104108  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0168  transcriptional repressor CodY  43.19 
 
 
262 aa  206  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  3.03115e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2721  transcriptional repressor CodY  43.51 
 
 
255 aa  198  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  1.05427e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2378  transcriptional repressor CodY  42.34 
 
 
262 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  5.94267e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2177  transcriptional repressor CodY  40.38 
 
 
264 aa  178  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.494459  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1982  pleiotropic transcriptional repressor  26.11 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>