43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2621 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2621  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  234  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1688  Dopa 45-dioxygenase  47.62 
 
 
115 aa  112  1e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0029  hypothetical protein  48.04 
 
 
108 aa  109  2e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.313279  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0035  dopa 4,5-dioxygenase  44.76 
 
 
125 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1678  hypothetical protein  42.31 
 
 
117 aa  102  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3138  hypothetical protein  44.12 
 
 
124 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.471828  decreased coverage  0.00930888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00410  putative dioxygenase  42.86 
 
 
125 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0163  hypothetical protein  42 
 
 
110 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1425  DOPA 45-dioxygenase  43.27 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.509648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0096  DOPA 45-dioxygenase  41.67 
 
 
110 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.00546e-08 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0096  DOPA 4,5-dioxygenase  40.74 
 
 
110 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0081  hypothetical protein  42.16 
 
 
123 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.000339661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0099  DOPA 45-dioxygenase  40.74 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  5.61986e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2138  Dopa 45-dioxygenase  40 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70015 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3249  DOPA 45-dioxygenase  40.2 
 
 
117 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2658  DOPA-dioxygenase-like  33.33 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5451  DOPA 45-dioxygenase  38.89 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0418054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3216  hypothetical protein  37.25 
 
 
132 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2245  hypothetical protein  36.79 
 
 
117 aa  83.2  1e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.68606  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0102  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like  37.62 
 
 
136 aa  80.5  7e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5429  DOPA 45-dioxygenase  37.62 
 
 
117 aa  80.5  8e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4881  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like protein  37.62 
 
 
117 aa  80.1  1e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290498  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1288  DOPA 4,5-dioxygenase  34.91 
 
 
117 aa  79.7  1e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3057  hypothetical protein  34.91 
 
 
117 aa  79.7  1e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1964  hypothetical protein  34.91 
 
 
117 aa  79.7  1e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2245  hypothetical protein  34.91 
 
 
117 aa  79.7  1e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2932  hypothetical protein  34.91 
 
 
117 aa  79.7  1e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0983  hypothetical protein  34.91 
 
 
117 aa  79.7  1e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917936  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1270  hypothetical protein  34.91 
 
 
117 aa  79.7  1e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0224  putative dioxygenase  37.25 
 
 
116 aa  79  2e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4715  DOPA 45-dioxygenase  37.62 
 
 
117 aa  78.6  3e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5557  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like protein  37.62 
 
 
117 aa  78.6  3e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5303  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like protein  37.62 
 
 
117 aa  78.6  3e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118492  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7107  Dopa 45-dioxygenase  35.29 
 
 
116 aa  74.3  5e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878058  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0838  hypothetical protein  31.18 
 
 
120 aa  72  3e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2296  Dopa 45-dioxygenase  34.69 
 
 
142 aa  62.8  2e-09  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.109564 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3645  Dopa 45-dioxygenase  28.28 
 
 
246 aa  60.5  7e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.177178 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0315  hypothetical protein  35.51 
 
 
109 aa  55.8  2e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05556  4,5-dioxygenase  32.98 
 
 
106 aa  53.5  1e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001586  aromatic ring-cleaving dioxygenase  35.79 
 
 
106 aa  52.4  2e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0614  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like protein  31.43 
 
 
143 aa  48.5  3e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.412688  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04806  conserved hypothetical protein  28.85 
 
 
188 aa  48.1  4e-05  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.612682 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30848  predicted protein  28.24 
 
 
178 aa  47.8  5e-05  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.91244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>