56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0532 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  100 
 
 		 449 aa  869    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  85.52 
 
 		 448 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  48.8 
 
 		 436 aa  338  9e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  47.87 
 
 		 397 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  47.38 
 
 		 513 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  45.22 
 
 		 599 aa  262  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  39.86 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  37.68 
 
 		 484 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  41.58 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  41.58 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  41.91 
 
 		 413 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  41.69 
 
 		 447 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  39.34 
 
 		 563 aa  233  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  37.99 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  35.97 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  42.53 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  42.28 
 
 		 424 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  42.28 
 
 		 424 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  43.49 
 
 		 427 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  36.75 
 
 		 484 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  42.38 
 
 		 480 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  38.4 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  38.69 
 
 		 416 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  38.6 
 
 		 386 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  41.81 
 
 		 345 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  42.64 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  33.12 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  32.75 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  41.11 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  35.84 
 
 		 404 aa  156  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  31.99 
 
 		 392 aa  140  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  29.97 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  25.92 
 
 		 382 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  28.5 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  28.72 
 
 		 404 aa  123  8e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  24.85 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  32.11 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  24.59 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  29.64 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  27.27 
 
 		 370 aa  113  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  33.18 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  27.89 
 
 		 416 aa  103  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  28.24 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  23.15 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  25.19 
 
 		 396 aa  87.8  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  25 
 
 		 260 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  25 
 
 		 260 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  26.84 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  23.71 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  28.64 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  20.92 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  21.26 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  21.26 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0533  multitransmembrane protein  21.86 
 
 		 258 aa  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  22.61 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  23.21 
 
 		 361 aa  46.6  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>