60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0019 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0019  putative transmembrane protein  100 
 
 
327 aa  645  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1183  protein of unknown function DUF979  66.46 
 
 
328 aa  418  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1970  protein of unknown function DUF979  52.92 
 
 
318 aa  326  4e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.555453  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2370  protein of unknown function DUF979  52.62 
 
 
318 aa  325  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0320038  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2167  hypothetical protein  51.55 
 
 
318 aa  322  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159278  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2569  protein of unknown function DUF979  51.4 
 
 
320 aa  314  1e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0066  hypothetical protein  49.07 
 
 
316 aa  309  3e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0091  hypothetical protein  50 
 
 
316 aa  309  3e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0006  hypothetical protein  49.84 
 
 
318 aa  307  2e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.686055 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3290  protein of unknown function DUF979  48.15 
 
 
329 aa  306  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2880  protein of unknown function DUF979  50.94 
 
 
317 aa  304  1e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1171  hypothetical protein  49.25 
 
 
339 aa  304  2e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00670549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1119  hypothetical protein  49.25 
 
 
339 aa  304  2e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0174836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3593  hypothetical protein  49.25 
 
 
339 aa  304  2e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1218  hypothetical protein  48.61 
 
 
331 aa  304  2e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5730  hypothetical protein  48.61 
 
 
317 aa  303  4e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290991  normal  0.578423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0872  hypothetical protein  48.46 
 
 
318 aa  298  9e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0814549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1259  hypothetical protein  48.65 
 
 
339 aa  295  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  normal  0.819314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0226  hypothetical protein  47.99 
 
 
318 aa  292  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0262  hypothetical protein  47.68 
 
 
318 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0249  hypothetical protein  47.68 
 
 
318 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2907  hypothetical protein  47.06 
 
 
318 aa  289  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0444  hypothetical protein  47.37 
 
 
318 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2976  hypothetical protein  47.37 
 
 
318 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3372  hypothetical protein  47.37 
 
 
318 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2115  hypothetical protein  47.37 
 
 
318 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3307  hypothetical protein  47.37 
 
 
318 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0191  hypothetical protein  48.36 
 
 
318 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3084  hypothetical protein  42.64 
 
 
320 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2012  hypothetical protein  47.09 
 
 
316 aa  275  1e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279391  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2152  hypothetical protein  43.25 
 
 
320 aa  270  3e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3098  hypothetical protein  43.25 
 
 
320 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3117  hypothetical protein  43.56 
 
 
320 aa  269  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3465  hypothetical protein  47.4 
 
 
316 aa  268  6e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2845  permease  43.25 
 
 
320 aa  268  6e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2878  hypothetical protein  43.25 
 
 
320 aa  268  6e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0377318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3116  hypothetical protein  43.25 
 
 
320 aa  268  6e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00155748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3093  hypothetical protein  43.25 
 
 
320 aa  268  6e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4306  hypothetical protein  47.4 
 
 
316 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4060  hypothetical protein  47.4 
 
 
316 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194368  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2806  permease  42.94 
 
 
320 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2057  hypothetical protein  44.34 
 
 
320 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0956308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2870  hypothetical protein  42.64 
 
 
320 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.742709  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3745  protein of unknown function DUF979  48.68 
 
 
318 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.412774  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0932  putative integral membrane protein  45.26 
 
 
317 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.692092  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4531  hypothetical protein  45.87 
 
 
316 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.622994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2481  hypothetical protein  45.68 
 
 
313 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3453  hypothetical protein  47.4 
 
 
316 aa  253  4e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3960  hypothetical protein  46.79 
 
 
316 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.558288 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1377  hypothetical protein  43.47 
 
 
317 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0438  protein of unknown function DUF979  43.34 
 
 
303 aa  238  7e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  7.27696e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0578  hypothetical protein  43.16 
 
 
317 aa  238  8e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0657  hypothetical protein  43.16 
 
 
317 aa  238  9e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1373  hypothetical protein  41.74 
 
 
318 aa  233  4e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0729092  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6524  protein of unknown function DUF979  38.94 
 
 
316 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163646  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1833  hypothetical protein  40.44 
 
 
307 aa  212  8e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.407427 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1679  hypothetical protein  39.18 
 
 
309 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.559939  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1414  hypothetical protein  39.18 
 
 
309 aa  205  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.488248  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0176  hypothetical protein  37.54 
 
 
332 aa  192  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0102471  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1236  protein of unknown function DUF979  37.42 
 
 
309 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>