71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2197 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2197  cobalt ABC transporter permease protein CbiQ  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2143  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  99.56 
 
 		 225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2190  cobalt ABC transporter permease CbiQ  99.56 
 
 		 225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.757374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2356  cobalt ABC transporter permease CbiQ  98.22 
 
 		 225 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.208194 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2243  cobalt ABC transporter permease CbiQ  98.67 
 
 		 225 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1707  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.22 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2603  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.34 
 
 		 256 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1220  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  31.42 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0184  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  26.32 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0187  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  25.88 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3734  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.09 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0430563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0325  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.28 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1268  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.24 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1859  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.73 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1062  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.17 
 
 		 264 aa  88.2  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.104457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2733  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.94 
 
 		 241 aa  85.1  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436058  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0095  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.48 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0144  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.39 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183976  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1191  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.77 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0727  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.19 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197575  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3822  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.41 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.19 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1698  cobalt ABC transporter CbiQ, inner membrane subunit  26.13 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000031286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1218  cobalt ABC transporter, permease protein  25.58 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2791  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.12 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295927  decreased coverage  0.000165031 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2331  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.35 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0578  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.24 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.852275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2148  cobalt transport protein  25.56 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0562  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.07 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1383  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.51 
 
 		 299 aa  72  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0529  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.52 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1295  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.66 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0707234  normal  0.0195569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4721  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.44 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2593  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.05 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.08926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  24.78 
 
 		 599 aa  68.6  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1704  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.14 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.9 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00358122  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3591  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.51 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1757  cobalt transport protein  32.58 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3658  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.11 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.411896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.01 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0792  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.54 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3890  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.01 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3207  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  21.17 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4180  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.11 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0541  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.18 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3002  cobalt ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0474  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  34.78 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.15 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0576637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1547  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.86 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302201  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1005  cobalt transport protein  24.62 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.08 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000100413  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2440  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  26.25 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0491  cobalt transport protein  24.46 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.641356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1802  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2761  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.48 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.79 
 
 		 260 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2020  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.3 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.75 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0714  cobalt transport protein  29.36 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2618  cobalt transport protein  23.47 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1280  cobalt ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15388  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0485  cobalt transport protein  23.57 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2003  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.91 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.1214e-25 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.76 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2006  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0118677  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1192  cobalt ABC transporter, permease protein, putative  27.07 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00889776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.81 
 
 		 266 aa  42  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2565  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.19 
 
 		 268 aa  42  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000511957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2634  cobalt transport protein  25.29 
 
 		 315 aa  41.6  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1183  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25 
 
 		 265 aa  41.6  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.239886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>