17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3260 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3260  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  829    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  24.92 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  24.03 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  25.65 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  24.21 
 
 		 368 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  25.76 
 
 		 365 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  24.92 
 
 		 354 aa  50.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  26.96 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  25.82 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  23.1 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  29.51 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  22.83 
 
 		 366 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  24.59 
 
 		 368 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  23.88 
 
 		 332 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0604603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  25.59 
 
 		 337 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  22.39 
 
 		 350 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1037  hypothetical protein  25.17 
 
 		 339 aa  43.1  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>