176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3298 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3298  dihydroxyacetone kinase, L subunit  100 
 
 		 221 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4110  dihydroxyacetone kinase, L subunit  88.64 
 
 		 220 aa  381  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0295747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2004  dihydroxyacetone kinase, L subunit  57.35 
 
 		 215 aa  213  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.419483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0073  dihydroxyacetone kinase, L subunit  54.59 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.706959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2583  dihydroxyacetone kinase, L subunit  51.96 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2073  dihydroxyacetone kinase subunit L  46.23 
 
 		 216 aa  205  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2008  dihydroxyacetone kinase, L subunit  51.47 
 
 		 210 aa  198  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1026  dihydroxyacetone kinase, L subunit  48.29 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0152559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4780  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.06 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2045  dihydroxyacetone kinase, L subunit  48.29 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1767  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.61 
 
 		 211 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1555  dihydroxyacetone kinase, L subunit  47 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1179  DAK2 domain-containing protein  49.24 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001637  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase ADP-binding subunit DhaL  43.63 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1102  dihydroxyacetone kinase, L subunit  48.74 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4271  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.14 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.207338 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4857  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  44.23 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  41.67 
 
 		 210 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2057  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.41 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0299195  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1942  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  41.18 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1343  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.12 
 
 		 204 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000571378  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0235  dihydroxyacetone kinase family protein  39.22 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.229043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1303  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  41.67 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01174  dihydroxyacetone kinase, C-terminal domain protein  41.67 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2449  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.67 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01184  hypothetical protein  41.67 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1660  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.85 
 
 		 218 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015384  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1358  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  41.67 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2427  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  41.67 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.52079  normal  0.545105 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1458  dihydroxyacetone kinase, L subunit  46.8 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.031951  normal  0.416542 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2221  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.58 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1155  dihydroxyacetone kinase, L subunit  54.86 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359439  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0973  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.16 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3047  dihydroxyacetone kinase, L subunit  50 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0336  dihydroxyacetone kinase, L subunit  47.83 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23890  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  49.73 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0484883  normal  0.421775 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1907  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.38 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2200  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.21 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29370  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  45.1 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0173  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.44 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2563  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.13 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  0.0624856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6113  dihydroxyacetone kinase, L subunit  47.54 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2346  dihydroxyacetone kinase, L subunit  46.45 
 
 		 210 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.516826  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2617  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.92 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0276564  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1569  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.79 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03260  Glycerone kinase  40.32 
 
 		 216 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000533446  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1459  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.78 
 
 		 252 aa  131  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0039  dihydroxyacetone phosphatase family protein  41.38 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0674  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.02 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13581  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0689  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.02 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0402893  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4072  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.96 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2329  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.33 
 
 		 211 aa  128  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1404  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.29 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1081  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.12 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1067  dihydroxyacetone kinase, subunit L  43.92 
 
 		 208 aa  125  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3826  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.56 
 
 		 212 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  37.57 
 
 		 598 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1263  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.71 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0080  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.27 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0961  dihydroxyacetone kinase, subunit L  38.81 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000657721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1105  dihydroxyacetone kinase, subunit L  38.81 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4661  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.7 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.439901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4394  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.69 
 
 		 211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2344  DAK2 domain-containing protein  37.77 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1638  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.1 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.275344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3916  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.55 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1651  dihydroxyacetone kinase family protein  34.48 
 
 		 192 aa  112  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  36.46 
 
 		 589 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2433  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.95 
 
 		 204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.107331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0878  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.11 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1571  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.25 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0215436  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4070  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.71 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1360  Dak phosphatase  43.58 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4752  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.55 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0429021  normal  0.328024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1402  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.1 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0650  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.47 
 
 		 213 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0141931  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  33 
 
 		 612 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3125  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.76 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3210  dihydroxyacetone kinase, L subunit  28.43 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5632  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.23 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3824  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.77 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6365  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.9 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0705  dihydroxyacetone kinase, subunit L  38.59 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0461  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.46 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0366  dihydroxyacetone kinase, subunit II  36.46 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1341  Dak phosphatase  36.79 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1797  dihydroxyacetone kinase family protein  35.52 
 
 		 554 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.510313  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1808  dihydroxyacetone kinase family protein  35.91 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112766  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0806  dihydroxyacetone kinase family protein  35.91 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1097  dihydroxyacetone kinase family protein  35.91 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83679  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  32.99 
 
 		 567 aa  98.2  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  30.39 
 
 		 583 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0355  dihydroxyacetone kinase, subunit L  29.38 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  30.69 
 
 		 583 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  31.19 
 
 		 583 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  30.69 
 
 		 583 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  34.02 
 
 		 567 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  28.71 
 
 		 582 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  35.32 
 
 		 616 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  30.69 
 
 		 583 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>