202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0076 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 		 580 aa  1150    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  87.22 
 
 		 580 aa  978    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  43.4 
 
 		 584 aa  500  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  47.56 
 
 		 576 aa  486  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4013  phosphotransferase domain-containing protein  47.45 
 
 		 578 aa  475  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  45.39 
 
 		 578 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  45.74 
 
 		 578 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1323  PHP domain protein  40.72 
 
 		 582 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  41.99 
 
 		 578 aa  455  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  43.5 
 
 		 588 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  41.99 
 
 		 594 aa  455  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  42.26 
 
 		 576 aa  449  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  45.37 
 
 		 574 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  42.19 
 
 		 574 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  41.74 
 
 		 577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  44.95 
 
 		 580 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  42.39 
 
 		 570 aa  442  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  41.29 
 
 		 569 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  44.21 
 
 		 579 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  39.41 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  45.25 
 
 		 577 aa  430  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1766  phosphotransferase domain-containing protein  45.5 
 
 		 576 aa  429  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  43.71 
 
 		 576 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  39.01 
 
 		 584 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  42.96 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  39.45 
 
 		 584 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  43.71 
 
 		 576 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  43.88 
 
 		 580 aa  420  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  44.14 
 
 		 583 aa  422  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  43.65 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  42.33 
 
 		 598 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  43.52 
 
 		 614 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0230  PHP-like protein  43.23 
 
 		 569 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  40.77 
 
 		 557 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  42.81 
 
 		 574 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  41.83 
 
 		 578 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000251601  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  43.84 
 
 		 650 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  42.26 
 
 		 586 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  42.81 
 
 		 574 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  43.89 
 
 		 642 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  38.62 
 
 		 570 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  41.01 
 
 		 560 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  37.02 
 
 		 570 aa  401  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  41.9 
 
 		 586 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2126  DNA-directed DNA polymerase  43.23 
 
 		 562 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  39.48 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  42.46 
 
 		 592 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  36.51 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  37.07 
 
 		 576 aa  395  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4410  PHP domain protein  44.03 
 
 		 582 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.969464 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4543  PHP domain protein  44.03 
 
 		 582 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00710379 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  41.01 
 
 		 562 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  36.44 
 
 		 570 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  36.44 
 
 		 570 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  44.81 
 
 		 586 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  38.45 
 
 		 572 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  38.45 
 
 		 572 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  38.49 
 
 		 573 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  38.49 
 
 		 573 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  38.32 
 
 		 573 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  38.45 
 
 		 572 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  38.28 
 
 		 572 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  38.28 
 
 		 572 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.11 
 
 		 740 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  37.97 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  38.73 
 
 		 572 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1302  phosphotransferase domain-containing protein  40.84 
 
 		 589 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  35.18 
 
 		 569 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0820  phosphotransferase domain-containing protein  42.76 
 
 		 575 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1288  PHP domain protein  41.77 
 
 		 592 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0703959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1389  PHP domain protein  41.43 
 
 		 592 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  35.31 
 
 		 571 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2809  phosphotransferase domain-containing protein  37.97 
 
 		 621 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102526  hitchhiker  0.000714673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1723  PHP domain protein  40.45 
 
 		 560 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00699818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2560  phosphoesterase, PHP-like  40.48 
 
 		 592 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.708367  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4386  phosphotransferase domain-containing protein  41.11 
 
 		 588 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0442  PHP domain protein  41.94 
 
 		 605 aa  347  5e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.372194 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4147  PHP-like  41.03 
 
 		 591 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011803  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4219  phosphotransferase domain-containing protein  41.03 
 
 		 591 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257415  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3298  phosphotransferase domain-containing protein  41.03 
 
 		 591 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.565465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1798  family X DNA polymerase IV  41.34 
 
 		 589 aa  343  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  39.69 
 
 		 543 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3642  phosphotransferase domain-containing protein  40.69 
 
 		 592 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4117  phosphotransferase domain-containing protein  40.52 
 
 		 592 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2830  PHP domain protein  33.67 
 
 		 577 aa  307  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2044  PHP domain protein  32.31 
 
 		 557 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5653  PHP domain protein  33.68 
 
 		 572 aa  296  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  33.56 
 
 		 563 aa  295  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1597  hypothetical protein  30.5 
 
 		 566 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3075  PHP domain protein  31.66 
 
 		 558 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  37.02 
 
 		 536 aa  283  9e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  35.37 
 
 		 532 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1609  PHP-like protein  34.86 
 
 		 572 aa  256  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.379827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  47.75 
 
 		 650 aa  252  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0226  hypothetical protein  44.66 
 
 		 356 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.171941  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4395  hypothetical protein  39.92 
 
 		 337 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0448  PHP domain protein  43.72 
 
 		 357 aa  183  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0395  hypothetical protein  40.83 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0198  hypothetical protein  41.5 
 
 		 356 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  41.76 
 
 		 339 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>