22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2087 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  100 
 
 		 685 aa  1365    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  87.5 
 
 		 701 aa  1157    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  41.6 
 
 		 650 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  44.47 
 
 		 521 aa  273  7e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  39.45 
 
 		 399 aa  252  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  36.67 
 
 		 739 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  39.11 
 
 		 746 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  39.78 
 
 		 643 aa  240  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  35.11 
 
 		 880 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  32.84 
 
 		 535 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  30.18 
 
 		 866 aa  220  7e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  34.6 
 
 		 576 aa  219  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  36.67 
 
 		 545 aa  213  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  30.58 
 
 		 572 aa  197  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  34.06 
 
 		 636 aa  196  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  34.43 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  31.23 
 
 		 525 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  33.05 
 
 		 377 aa  150  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  33.45 
 
 		 317 aa  139  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1027 aa  61.6  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  33.01 
 
 		 615 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  34.91 
 
 		 616 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>