45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5764 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5764  protein of unknown function DUF1349  100 
 
 
194 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000000913507  normal  0.562373 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6671  protein of unknown function DUF1349  87.11 
 
 
194 aa  357  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00171031  normal  0.066277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2454  hypothetical protein  74.23 
 
 
195 aa  303  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3819  hypothetical protein  56.32 
 
 
191 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4071  hypothetical protein  54.74 
 
 
191 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0615371  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4314  hypothetical protein  47.31 
 
 
191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0820719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1579  protein of unknown function DUF1349  39.88 
 
 
179 aa  140  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157914  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2143  protein of unknown function DUF1349  40 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4540  hypothetical protein  40 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1749  protein of unknown function DUF1349  38.51 
 
 
180 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2937  protein of unknown function DUF1349  36.21 
 
 
181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3213  protein of unknown function DUF1349  40 
 
 
195 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1507  protein of unknown function DUF1349  36.56 
 
 
203 aa  125  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.449634  normal  0.257305 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1564  protein of unknown function DUF1349  41.04 
 
 
176 aa  121  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0761212  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07990  hypothetical protein  37.5 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2931  hypothetical protein  34.64 
 
 
209 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4328  protein of unknown function DUF1349  34.43 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.683999  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0097  protein of unknown function DUF1349  33.71 
 
 
216 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000978689  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4481  hypothetical protein  34.1 
 
 
216 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1147  protein of unknown function DUF1349  33.33 
 
 
199 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4025  hypothetical protein  29.06 
 
 
211 aa  101  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0661  protein of unknown function DUF1349  27.51 
 
 
193 aa  100  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15801  predicted protein  29.48 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3279  protein of unknown function DUF1349  24.76 
 
 
222 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0837  hypothetical protein  25.97 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2842  protein of unknown function DUF1349  24.29 
 
 
222 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.650239  normal  0.12049 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2234  hypothetical protein  30 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000537336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2458  hypothetical protein  30 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2191  hypothetical protein  30 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00552643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2274  hypothetical protein  30 
 
 
209 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2442  hypothetical protein  30 
 
 
198 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2536  hypothetical protein  30 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.278  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1176  protein of unknown function DUF1349  25.57 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36940  predicted protein  29.15 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2473  hypothetical protein  29.44 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0333618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2248  hypothetical protein  29.83 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000136964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2399  hypothetical protein  28.18 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2934  hypothetical protein  28.18 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404051  hitchhiker  0.0000430397 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0316  hypothetical protein  25.99 
 
 
233 aa  64.3  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1434  hypothetical protein  24.31 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0614  protein of unknown function DUF1349  26.32 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.274963 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07484  Uncharacterized protein AN7484 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW46]  41.38 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1441  hypothetical protein  26.19 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3715  hypothetical protein  22.16 
 
 
235 aa  44.7  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2053  protein of unknown function DUF1349  25.74 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.144756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>