More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1309 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  100 
 
 
247 aa  505  1e-142  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  87.45 
 
 
247 aa  427  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  84.62 
 
 
293 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  86.64 
 
 
247 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  85.78 
 
 
250 aa  417  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  85.02 
 
 
247 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  86.09 
 
 
247 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  85.65 
 
 
247 aa  416  1e-115  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  80.16 
 
 
247 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  78.14 
 
 
436 aa  390  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  76.92 
 
 
248 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  77.33 
 
 
248 aa  384  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  76.11 
 
 
251 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  76.11 
 
 
248 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  76.11 
 
 
251 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  76.92 
 
 
248 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  76.11 
 
 
267 aa  381  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  72.47 
 
 
247 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  76.11 
 
 
270 aa  377  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  75.3 
 
 
249 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  75.3 
 
 
249 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  75.3 
 
 
249 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  76.29 
 
 
250 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  75.3 
 
 
249 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  75.3 
 
 
249 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  74.9 
 
 
270 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  74.9 
 
 
248 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  74.9 
 
 
270 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  75.3 
 
 
249 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  75.3 
 
 
249 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  74.49 
 
 
248 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  74.49 
 
 
270 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  73.68 
 
 
248 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  75.11 
 
 
247 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  77.19 
 
 
245 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  68.02 
 
 
249 aa  362  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  66.4 
 
 
247 aa  353  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  65.99 
 
 
247 aa  352  3e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  65.59 
 
 
247 aa  351  6e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 
251 aa  350  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  67.21 
 
 
249 aa  350  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  68.97 
 
 
247 aa  348  5e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  69.83 
 
 
247 aa  347  8e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  66.26 
 
 
251 aa  346  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  9.97316e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  63.16 
 
 
248 aa  341  6e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  69.74 
 
 
229 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  66.26 
 
 
247 aa  339  3e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  68.86 
 
 
229 aa  335  3e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  65.16 
 
 
249 aa  334  8e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  64.9 
 
 
250 aa  331  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  64.49 
 
 
250 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  64.49 
 
 
250 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 
250 aa  329  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 
250 aa  329  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  65.99 
 
 
253 aa  328  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  65.5 
 
 
245 aa  327  9e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  63.16 
 
 
249 aa  327  1e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 
250 aa  327  1e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  64.08 
 
 
250 aa  327  1e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 
250 aa  327  1e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 
250 aa  327  1e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 
250 aa  327  1e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 
250 aa  327  1e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  64.08 
 
 
250 aa  327  1e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  64.08 
 
 
250 aa  327  1e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  63.67 
 
 
250 aa  326  2e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  64.63 
 
 
247 aa  325  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  63.82 
 
 
248 aa  325  4e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  64.63 
 
 
245 aa  324  9e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  62.86 
 
 
250 aa  322  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  64.91 
 
 
245 aa  322  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  64.63 
 
 
245 aa  321  6e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  60.32 
 
 
248 aa  321  7e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  64.63 
 
 
245 aa  320  1e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  64.49 
 
 
250 aa  320  1e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  64.9 
 
 
250 aa  320  1e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  63.67 
 
 
250 aa  320  1e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  65.07 
 
 
245 aa  320  2e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  65.07 
 
 
245 aa  320  2e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  65.07 
 
 
245 aa  320  2e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  62.04 
 
 
250 aa  319  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  63.67 
 
 
250 aa  319  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  62.04 
 
 
250 aa  319  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  62.04 
 
 
250 aa  319  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  64.63 
 
 
245 aa  318  4e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.23662e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  64.63 
 
 
245 aa  318  4e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  64.63 
 
 
245 aa  318  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  59.76 
 
 
248 aa  318  5e-86  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  62.86 
 
 
250 aa  317  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  61.54 
 
 
248 aa  313  2e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  61.97 
 
 
234 aa  313  2e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  58.54 
 
 
248 aa  312  4e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  62.28 
 
 
234 aa  311  8e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  62.88 
 
 
240 aa  308  7e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  55.74 
 
 
247 aa  305  6e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  61 
 
 
246 aa  304  7e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  62.61 
 
 
229 aa  302  4e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  60.82 
 
 
249 aa  298  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  55.28 
 
 
248 aa  294  8e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.96 
 
 
249 aa  294  9e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>