165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0829 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  63.07 
 
 		 574 aa  709    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  61.28 
 
 		 576 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  60.98 
 
 		 574 aa  691    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  60.38 
 
 		 650 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  60.07 
 
 		 598 aa  696    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  60.52 
 
 		 614 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  100 
 
 		 580 aa  1157    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0820  phosphotransferase domain-containing protein  66.9 
 
 		 575 aa  723    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  60.21 
 
 		 642 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  61.28 
 
 		 576 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  59.56 
 
 		 740 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1798  family X DNA polymerase IV  57.96 
 
 		 589 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4147  PHP-like  57.96 
 
 		 591 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011803  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4219  phosphotransferase domain-containing protein  57.96 
 
 		 591 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257415  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3298  phosphotransferase domain-containing protein  57.96 
 
 		 591 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.565465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4543  PHP domain protein  57.91 
 
 		 582 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00710379 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4410  PHP domain protein  57.91 
 
 		 582 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.969464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  54.55 
 
 		 574 aa  594  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  50.18 
 
 		 594 aa  593  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  50.18 
 
 		 578 aa  592  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3642  phosphotransferase domain-containing protein  56.67 
 
 		 592 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4386  phosphotransferase domain-containing protein  56.04 
 
 		 588 aa  581  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4117  phosphotransferase domain-containing protein  56.5 
 
 		 592 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  52.28 
 
 		 574 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  43.94 
 
 		 577 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  44.89 
 
 		 576 aa  472  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  45.87 
 
 		 570 aa  474  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  43.82 
 
 		 578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  43.57 
 
 		 578 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  41.84 
 
 		 580 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  43.8 
 
 		 576 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1766  phosphotransferase domain-containing protein  45.71 
 
 		 576 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  44.95 
 
 		 580 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  39.01 
 
 		 570 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  43.33 
 
 		 579 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  40.38 
 
 		 584 aa  432  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  40.53 
 
 		 569 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  42.81 
 
 		 578 aa  425  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000251601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  37.48 
 
 		 570 aa  419  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  41.07 
 
 		 588 aa  412  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1302  phosphotransferase domain-containing protein  44 
 
 		 589 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  43.73 
 
 		 580 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  41.3 
 
 		 583 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  39.54 
 
 		 584 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  41.87 
 
 		 592 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  39.06 
 
 		 584 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0230  PHP-like protein  41.68 
 
 		 569 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1323  PHP domain protein  37.26 
 
 		 582 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  36.95 
 
 		 573 aa  399  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  41.24 
 
 		 580 aa  395  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1288  PHP domain protein  43.9 
 
 		 592 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0703959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  39.83 
 
 		 572 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  40.69 
 
 		 577 aa  391  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  42.45 
 
 		 586 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1389  PHP domain protein  43.73 
 
 		 592 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2560  phosphoesterase, PHP-like  43.9 
 
 		 592 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.708367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  38.34 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  40.6 
 
 		 562 aa  385  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  39.83 
 
 		 586 aa  383  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  38.88 
 
 		 572 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  38.88 
 
 		 572 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  38.88 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  39.3 
 
 		 560 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  38.88 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  38.53 
 
 		 572 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  40.87 
 
 		 574 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  38.88 
 
 		 572 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  38.53 
 
 		 573 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  38.7 
 
 		 573 aa  379  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  38.61 
 
 		 572 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  38.53 
 
 		 572 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  38.53 
 
 		 572 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2126  DNA-directed DNA polymerase  40.31 
 
 		 562 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  35.69 
 
 		 571 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  43.73 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  35.08 
 
 		 576 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  35.29 
 
 		 569 aa  349  9e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4013  phosphotransferase domain-containing protein  37.92 
 
 		 578 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1723  PHP domain protein  38.75 
 
 		 560 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00699818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0442  PHP domain protein  38.7 
 
 		 605 aa  333  7.000000000000001e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.372194 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  34.94 
 
 		 570 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  34.94 
 
 		 570 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  38.2 
 
 		 543 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1597  hypothetical protein  33.45 
 
 		 566 aa  301  2e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5653  PHP domain protein  32.25 
 
 		 572 aa  294  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  36.96 
 
 		 536 aa  289  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3075  PHP domain protein  33.27 
 
 		 558 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2830  PHP domain protein  33.1 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  35.58 
 
 		 532 aa  273  8.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2044  PHP domain protein  29.82 
 
 		 557 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  30.62 
 
 		 563 aa  262  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1609  PHP-like protein  36.73 
 
 		 572 aa  253  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.379827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  48.52 
 
 		 650 aa  243  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2809  phosphotransferase domain-containing protein  42.61 
 
 		 621 aa  217  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102526  hitchhiker  0.000714673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0395  hypothetical protein  42.92 
 
 		 339 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4395  hypothetical protein  41.2 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0226  hypothetical protein  41.56 
 
 		 356 aa  159  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.171941  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  38.22 
 
 		 339 aa  155  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5687  hypothetical protein  40.34 
 
 		 335 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1121  hypothetical protein  40.53 
 
 		 334 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>