245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2817 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_2817  7-cyano-7-deazaguanine reductase  100 
 
 
158 aa  325  1e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.153581  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2779  7-cyano-7-deazaguanine reductase  93.67 
 
 
158 aa  306  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2482  7-cyano-7-deazaguanine reductase  87.34 
 
 
158 aa  292  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.245028  normal  0.291037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3217  7-cyano-7-deazaguanine reductase  85.44 
 
 
158 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4472  7-cyano-7-deazaguanine reductase  82.28 
 
 
158 aa  275  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.51352  normal  0.783738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1742  7-cyano-7-deazaguanine reductase  78.34 
 
 
158 aa  266  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1828  7-cyano-7-deazaguanine reductase  77.85 
 
 
158 aa  255  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3151  7-cyano-7-deazaguanine reductase  73.42 
 
 
154 aa  245  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0333619  normal  0.222915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3756  7-cyano-7-deazaguanine reductase  78.47 
 
 
151 aa  243  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3011  7-cyano-7-deazaguanine reductase  78.47 
 
 
153 aa  241  2e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2783  7-cyano-7-deazaguanine reductase  78.47 
 
 
153 aa  241  2e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3063  7-cyano-7-deazaguanine reductase  76.16 
 
 
156 aa  240  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2906  7-cyano-7-deazaguanine reductase  77.08 
 
 
153 aa  238  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.61276  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3774  7-cyano-7-deazaguanine reductase  76.71 
 
 
150 aa  237  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4182  7-cyano-7-deazaguanine reductase  76.39 
 
 
154 aa  237  6e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  1.04861e-05  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0983  7-cyano-7-deazaguanine reductase  75.86 
 
 
162 aa  236  7e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3262  7-cyano-7-deazaguanine reductase  71.05 
 
 
154 aa  236  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1463  7-cyano-7-deazaguanine reductase  75.52 
 
 
152 aa  236  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4288  7-cyano-7-deazaguanine reductase  73.79 
 
 
150 aa  234  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.542741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2044  7-cyano-7-deazaguanine reductase  73.61 
 
 
154 aa  233  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5893  7-cyano-7-deazaguanine reductase  74.66 
 
 
150 aa  233  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6510  7-cyano-7-deazaguanine reductase  73.97 
 
 
150 aa  233  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1144  7-cyano-7-deazaguanine reductase  74.31 
 
 
155 aa  232  1e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.594767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1183  7-cyano-7-deazaguanine reductase  74.31 
 
 
155 aa  232  1e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2007  7-cyano-7-deazaguanine reductase  71.24 
 
 
155 aa  232  2e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2808  7-cyano-7-deazaguanine reductase  70.39 
 
 
154 aa  231  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146173  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3074  7-cyano-7-deazaguanine reductase  70.39 
 
 
154 aa  231  4e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2293  7-cyano-7-deazaguanine reductase  70.39 
 
 
154 aa  229  8e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156672  normal  0.158019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2551  7-cyano-7-deazaguanine reductase  73.79 
 
 
166 aa  228  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.914539  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1844  7-cyano-7-deazaguanine reductase  64.33 
 
 
174 aa  218  2e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0512  7-cyano-7-deazaguanine reductase  72.22 
 
 
153 aa  218  2e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.642782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1341  7-cyano-7-deazaguanine reductase  68.06 
 
 
154 aa  216  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0442  7-cyano-7-deazaguanine reductase  71.03 
 
 
153 aa  213  1e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1311  7-cyano-7-deazaguanine reductase  64.78 
 
 
159 aa  210  5e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1060  7-cyano-7-deazaguanine reductase  68.06 
 
 
153 aa  206  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.356271  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1461  7-cyano-7-deazaguanine reductase  75.79 
 
 
99 aa  158  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.554922  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1983  7-cyano-7-deazaguanine reductase  52.48 
 
 
155 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0872  7-cyano-7-deazaguanine reductase  51.3 
 
 
163 aa  131  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.697802  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22450  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.8 
 
 
166 aa  130  9e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.914422 
 
 
-
 
NC_002950  PG1347  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50 
 
 
154 aa  130  1e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12670  7-cyano-7-deazaguanine reductase  52.14 
 
 
180 aa  129  2e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.883565  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0769  7-cyano-7-deazaguanine reductase  52.29 
 
 
166 aa  125  2e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0751  7-cyano-7-deazaguanine reductase  52.29 
 
 
166 aa  125  2e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172139  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0394  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.97 
 
 
166 aa  125  2e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1067  7-cyano-7-deazaguanine reductase  51.38 
 
 
165 aa  121  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1397  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.38 
 
 
165 aa  120  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3946  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.38 
 
 
165 aa  120  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105864  normal  0.027298 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1233  7-cyano-7-deazaguanine reductase  51.38 
 
 
165 aa  120  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1500  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.38 
 
 
165 aa  120  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.20055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1235  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.38 
 
 
165 aa  120  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1362  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.38 
 
 
165 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0220025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1260  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.38 
 
 
165 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1461  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.38 
 
 
165 aa  120  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256472  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1433  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.38 
 
 
165 aa  120  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.99367e-14 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1259  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.38 
 
 
165 aa  120  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1773  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.17 
 
 
165 aa  120  1e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0752  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.38 
 
 
141 aa  119  2e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.384081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0899  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.38 
 
 
141 aa  119  2e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.826218  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1644  7-cyano-7-deazaguanine reductase  51.89 
 
 
155 aa  116  1e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2025  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.03 
 
 
165 aa  112  1e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0305179  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1227  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.86 
 
 
139 aa  113  1e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0657865  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3304  GTP cyclohydrolase I  49.59 
 
 
143 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0577571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1809  GTP cyclohydrolase I-related enzyme  46.28 
 
 
161 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0160  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.27 
 
 
129 aa  107  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0644  GTP cyclohydrolase I  48.6 
 
 
139 aa  107  9e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.486051  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1886  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.83 
 
 
136 aa  106  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0653  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.4 
 
 
144 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1347  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44 
 
 
188 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0653  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.86 
 
 
167 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2027  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.49 
 
 
129 aa  104  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4244  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.74 
 
 
122 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0237434  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4219  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.74 
 
 
122 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4094  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.86 
 
 
159 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0823325  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2723  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.79 
 
 
118 aa  101  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.819382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0331  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45 
 
 
122 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0279234  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1400  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.87 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0678  GTP cyclohydrolase I  41.38 
 
 
129 aa  99.4  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2063  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.57 
 
 
117 aa  99  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1696  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.79 
 
 
129 aa  97.4  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.510769  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2441  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.43 
 
 
129 aa  97.1  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00534909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1881  GTP cyclohydrolase I  44.34 
 
 
118 aa  97.4  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3421  GTP cyclohydrolase I  41.23 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0847539  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1578  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.45 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.921264 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1181  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.75 
 
 
128 aa  90.9  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0840  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.16 
 
 
123 aa  89  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000632254  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0007  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.11 
 
 
131 aa  89  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0282  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.18 
 
 
119 aa  87.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.290856  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0004  7-cyano-7-deazaguanine reductase  36.79 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1759  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.4 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1849  response regulator  40.91 
 
 
198 aa  86.3  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0579  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.45 
 
 
118 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.254846 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0561  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.4 
 
 
116 aa  86.3  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0991  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.81 
 
 
140 aa  84.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.279771  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18601  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.81 
 
 
128 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.780472  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1892  7-cyano-7-deazaguanine reductase  35.92 
 
 
127 aa  84  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0006  NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase (NADPH-dependent nitrile oxidoreductase)  38.64 
 
 
184 aa  84  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0608  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.05 
 
 
142 aa  84  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0020  7-cyano-7-deazaguanine reductase  35.92 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2097  7-cyano-7-deazaguanine reductase  34.95 
 
 
126 aa  83.2  1e-15  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0006  7-cyano-7-deazaguanine reductase  34.95 
 
 
127 aa  81.3  5e-15  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>