244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0653 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0653  7-cyano-7-deazaguanine reductase  100 
 
 
167 aa  348  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2025  7-cyano-7-deazaguanine reductase  66.06 
 
 
165 aa  226  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0305179  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1347  7-cyano-7-deazaguanine reductase  65.64 
 
 
188 aa  224  6e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1773  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.79 
 
 
165 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2723  7-cyano-7-deazaguanine reductase  53.98 
 
 
118 aa  124  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.819382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1397  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.42 
 
 
165 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3946  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.42 
 
 
165 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105864  normal  0.027298 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0872  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.44 
 
 
163 aa  120  7e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.697802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1233  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.76 
 
 
165 aa  120  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1500  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.76 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000420055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1461  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.76 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1260  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.76 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1235  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.76 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1362  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.76 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0220025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1433  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.76 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000199367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1259  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.11 
 
 
165 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1067  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.11 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1844  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.63 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0769  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.92 
 
 
166 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0751  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.92 
 
 
166 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0160  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50.45 
 
 
129 aa  117  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1347  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0394  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.74 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1886  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.06 
 
 
136 aa  116  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22450  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.67 
 
 
166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.914422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1463  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.33 
 
 
152 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1311  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.7 
 
 
159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2783  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.5 
 
 
153 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3011  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.5 
 
 
153 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2906  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.5 
 
 
153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.61276  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0678  GTP cyclohydrolase I  50.45 
 
 
129 aa  114  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3151  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.38 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0333619  normal  0.222915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1227  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.55 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0657865  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12670  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.07 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.883565  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0653  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.18 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1644  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.95 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0608  7-cyano-7-deazaguanine reductase  53.54 
 
 
142 aa  112  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3421  GTP cyclohydrolase I  43.9 
 
 
128 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0847539  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3262  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.83 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1696  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.75 
 
 
129 aa  111  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.510769  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4244  7-cyano-7-deazaguanine reductase  51.4 
 
 
122 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0237434  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4219  7-cyano-7-deazaguanine reductase  51.4 
 
 
122 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3304  GTP cyclohydrolase I  46.83 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0577571  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1759  7-cyano-7-deazaguanine reductase  52.48 
 
 
116 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4094  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50.47 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0823325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2808  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.86 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146173  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4288  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.12 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.542741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3074  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.86 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1341  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.75 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0331  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.53 
 
 
122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0279234  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2007  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.6 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0579  7-cyano-7-deazaguanine reductase  53.54 
 
 
118 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.254846 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0644  GTP cyclohydrolase I  46.85 
 
 
139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.486051  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6510  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.51 
 
 
150 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2293  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.3 
 
 
154 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156672  normal  0.158019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2779  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.86 
 
 
158 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3774  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.94 
 
 
150 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1627  7-cyano-7-deazaguanine reductase  51.52 
 
 
116 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.206183 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2441  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.11 
 
 
129 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00534909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1183  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.08 
 
 
155 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1144  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.08 
 
 
155 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.594767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3756  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.94 
 
 
151 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5893  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.51 
 
 
150 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0752  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.46 
 
 
141 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.384081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0899  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.46 
 
 
141 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.826218  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2817  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.86 
 
 
158 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.153581  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0512  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.71 
 
 
153 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.642782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0983  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.95 
 
 
162 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1809  GTP cyclohydrolase I-related enzyme  44.35 
 
 
161 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0561  7-cyano-7-deazaguanine reductase  51.52 
 
 
116 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0282  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.79 
 
 
119 aa  104  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.290856  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4472  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.86 
 
 
158 aa  104  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.51352  normal  0.783738 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0685  7-cyano-7-deazaguanine reductase  52.53 
 
 
116 aa  104  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0514  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50.51 
 
 
118 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1742  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.13 
 
 
158 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1828  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.46 
 
 
158 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2027  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.06 
 
 
129 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2551  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.15 
 
 
166 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.914539  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1400  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.55 
 
 
139 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4182  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.24 
 
 
154 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0000104861  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1832  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.67 
 
 
132 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.220331  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2044  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.79 
 
 
154 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0442  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.89 
 
 
153 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3063  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.75 
 
 
156 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1881  GTP cyclohydrolase I  47.17 
 
 
118 aa  100  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1060  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.22 
 
 
153 aa  100  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.356271  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0840  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.04 
 
 
123 aa  100  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000632254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2482  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.16 
 
 
158 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.245028  normal  0.291037 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1140  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.45 
 
 
132 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.972823  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3217  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.23 
 
 
158 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21838  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1578  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.14 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.921264 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2063  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.98 
 
 
117 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1983  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.87 
 
 
155 aa  95.5  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0230  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.04 
 
 
142 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1181  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2198  GTP cyclohydrolase I  46.32 
 
 
134 aa  88.6  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2098  7-cyano-7-deazaguanine reductase  37.59 
 
 
141 aa  88.6  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.819295  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2643  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.57 
 
 
131 aa  86.3  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0991  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39 
 
 
140 aa  84.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.279771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4416  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.12 
 
 
136 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>