193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3499 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_3499  O-methyltransferase family protein  100 
 
 
231 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0019  O-methyltransferase family protein  74.46 
 
 
229 aa  350  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4360  O-methyltransferase family 3  47.65 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3183  putative O-methyltransferase  41.15 
 
 
220 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46300  hypothetical protein  38.18 
 
 
221 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219143  normal  0.0356086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3938  hypothetical protein  37.27 
 
 
221 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0913  O-methyltransferase  37.56 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0962  O-methyltransferase family protein  38.74 
 
 
223 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4690  O-methyltransferase family protein  48.37 
 
 
219 aa  121  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0236  O-methyltransferase family protein  50.33 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2526  O-methyltransferase family 3  45.81 
 
 
217 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5446  O-methyltransferase family protein  49.02 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5416  O-methyltransferase family protein  49.02 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4853  O-methyltransferase family protein  49.02 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4857  O-methyltransferase family protein  36.07 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5302  O-methyltransferase family protein  50.33 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3883  O-methyltransferase family 3  41.88 
 
 
216 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1960  O-methyltransferase family protein  41.14 
 
 
222 aa  111  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.467519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4757  O-methyltransferase family protein  49.67 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3394  O-methyltransferase family protein  44.52 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3675  O-methyltransferase family 3  40.39 
 
 
231 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.264333  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0886  O-methyltransferase family 3  42.86 
 
 
231 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0398072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0739  O-methyltransferase family protein  42.59 
 
 
231 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312186  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2385  O-methyltransferase family protein  39.84 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6637  O-methyltransferase family protein  33.72 
 
 
238 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635132  normal  0.124721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1768  O-methyltransferase family protein  39.06 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2380  O-methyltransferase family protein  39.06 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1386  putative O-methyltransferase  30 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4338  O-methyltransferase family 3  30.23 
 
 
238 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.209167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37960  O-methyltransferase  33.33 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2172  O-methyltransferase family 3  38.21 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0521559  normal  0.503849 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2447  O-methyltransferase family 3  34.29 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03236  O-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01830)  32.7 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.659946 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1444  O-methyltransferase family protein  36.59 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3051  O-methyltransferase family 3  33.92 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3189  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  35.61 
 
 
220 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.873252  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03260  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0145288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2823  O-methyltransferase family 3  34.96 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0209  O-methyltransferase family 3  25.14 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0668  O-methyltransferase family 3  33.87 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00516172  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0279  O-methyltransferase family 3  31.2 
 
 
207 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2155  O-methyltransferase family 3  34.43 
 
 
221 aa  62.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261573  normal  0.370065 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06402  conserved hypothetical protein  30.61 
 
 
816 aa  62  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0546217 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1914  hypothetical protein  37.74 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0176  O-methyltransferase family 3  33.86 
 
 
192 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.951952  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2832  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  31.01 
 
 
225 aa  59.3  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2978  O-methyltransferase family protein  30.77 
 
 
209 aa  58.9  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0904  O-methyltransferase family 3  27.85 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4077  O-methyltransferase family protein  29.1 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00728194  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1057  O-methyltransferase family protein  29.13 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.773239  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01450  predicted O-methyltransferase  33.06 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.580973 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14350  predicted O-methyltransferase  29.77 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.272747  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36800  catechol o- methyltransferase  23.76 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.19836  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3436  O-methyltransferase family protein  33.33 
 
 
210 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2166  O-methyltransferase family 3  31.58 
 
 
232 aa  55.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132744  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1748  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  29.3 
 
 
219 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10188  O-methyltransferase  33.87 
 
 
218 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.153182  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02207  O-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06990)  32.21 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.886788  normal  0.899254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5071  O-methyltransferase  26.18 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0734  O-methyltransferase family 3  29.03 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3101  O-methyltransferase family 3  30.33 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0144  O-methyltransferase family protein  30.65 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0960801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2678  hypothetical protein  30.72 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0153  O-methyltransferase family protein  30.65 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0134  O-methyltransferase family protein  30.65 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.670922  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37392  predicted protein  27.98 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000419488  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13360  predicted O-methyltransferase  33.08 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.693653  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5032  O-methyltransferase family protein  29.55 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404122  normal  0.657554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1742  O-methyltransferase family protein  26.99 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2025  O-methyltransferase family protein  26.99 
 
 
214 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05830  O-methyltransferase family 3  30.83 
 
 
212 aa  52.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00143828  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0754  O-methyltransferase  27.42 
 
 
219 aa  52  0.000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.95723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4691  hypothetical protein  36.36 
 
 
241 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0193  O-methyltransferase family 3  30.94 
 
 
222 aa  52  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1473  O-methyltransferase family 3  27.64 
 
 
213 aa  52  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0273584  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4674  O-methyltransferase family protein  28.79 
 
 
222 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3689  O-methyltransferase family protein  28.79 
 
 
222 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0986  O-methyltransferase family protein  35.25 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0314  O-methyltransferase family protein  35.25 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0301267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3280  catechol O-methyltransferase  34.33 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0388  O-methyltransferase family protein  35.25 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0253  O-methyltransferase family protein  35.25 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119274  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1839  O-methyltransferase family protein  35.25 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1343  O-methyltransferase family protein  35.25 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4693  O-methyltransferase family 3  31.15 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555176  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2965  O-methyltransferase family protein  29.55 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4178  hypothetical protein  27.5 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00335218  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2421  O-methyltransferase family protein  28.79 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2588  SAM-dependent methyltransferase; O-methyltransferase  30.66 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4298  O-methyltransferase family protein  29.55 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1754  O-methyltransferase family protein  35.25 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03537  catecholamine-O-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00150)  29.87 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2215  O-methyltransferase family 3  30.88 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3277  O-methyltransferase family protein  29.21 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0468  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  29.32 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2930  O-methyltransferase family protein  30.89 
 
 
196 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1776  O-methyltransferase  28.68 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2853  O-methyltransferase family 3  27.59 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0900175  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0923  O-methyltransferase family 3  25.41 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0807  O-methyltransferase family protein  23.12 
 
 
235 aa  49.3  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0035936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>