36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4691 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4691  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  491  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2191  hypothetical protein  51.97 
 
 
236 aa  234  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000770677  hitchhiker  0.000224461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2678  hypothetical protein  36.54 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1914  hypothetical protein  28.9 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2526  O-methyltransferase family 3  34.48 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3394  O-methyltransferase family protein  29.53 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0019  O-methyltransferase family protein  39.33 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0962  O-methyltransferase family protein  28.31 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3883  O-methyltransferase family 3  30.08 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0770  hypothetical protein  29.37 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0886  O-methyltransferase family 3  29.75 
 
 
231 aa  52  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0398072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3499  O-methyltransferase family protein  36.36 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0913  O-methyltransferase  30.71 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4857  O-methyltransferase family protein  32.98 
 
 
221 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3183  putative O-methyltransferase  27.48 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4690  O-methyltransferase family protein  33.33 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3938  hypothetical protein  28.22 
 
 
221 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1960  O-methyltransferase family protein  32.65 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.467519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3032  hypothetical protein  29.51 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0073  O-methyltransferase family 3  25 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6910  O-methyltransferase family 3  26.36 
 
 
214 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.283882  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46300  hypothetical protein  27.64 
 
 
221 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219143  normal  0.0356086 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2518  O-methyltransferase-like  26.25 
 
 
256 aa  45.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2172  O-methyltransferase family 3  26.5 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0521559  normal  0.503849 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2823  O-methyltransferase family 3  26.11 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37960  O-methyltransferase  25.19 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5446  O-methyltransferase family protein  29.79 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5416  O-methyltransferase family protein  29.79 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1123  hypothetical protein  48.84 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0236  O-methyltransferase family protein  27.82 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2447  O-methyltransferase family 3  23.77 
 
 
203 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2215  O-methyltransferase family 3  27.13 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4853  O-methyltransferase family protein  30.85 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3675  O-methyltransferase family 3  28.97 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.264333  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0739  O-methyltransferase family protein  28.18 
 
 
231 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312186  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0285  O-methyltransferase  24 
 
 
266 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.1699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>