201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3675 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3675  O-methyltransferase family 3  100 
 
 
231 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.264333  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0739  O-methyltransferase family protein  86.15 
 
 
231 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312186  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0886  O-methyltransferase family 3  70.87 
 
 
231 aa  321  7e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0398072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0962  O-methyltransferase family protein  47.84 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0236  O-methyltransferase family protein  47.21 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0913  O-methyltransferase  46.44 
 
 
221 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3183  putative O-methyltransferase  48.62 
 
 
220 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3394  O-methyltransferase family protein  46.78 
 
 
221 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46300  hypothetical protein  45.92 
 
 
221 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219143  normal  0.0356086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3938  hypothetical protein  45.38 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4853  O-methyltransferase family protein  50.25 
 
 
220 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5446  O-methyltransferase family protein  48.17 
 
 
221 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5416  O-methyltransferase family protein  48.17 
 
 
221 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4857  O-methyltransferase family protein  45.49 
 
 
221 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4690  O-methyltransferase family protein  54.17 
 
 
219 aa  168  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2526  O-methyltransferase family 3  45.25 
 
 
217 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3883  O-methyltransferase family 3  44.21 
 
 
216 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1960  O-methyltransferase family protein  48.89 
 
 
222 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.467519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5302  O-methyltransferase family protein  46.98 
 
 
221 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242242 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4757  O-methyltransferase family protein  46.55 
 
 
241 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4360  O-methyltransferase family 3  41.72 
 
 
238 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0019  O-methyltransferase family protein  49.34 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3499  O-methyltransferase family protein  40.39 
 
 
231 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1768  O-methyltransferase family protein  36.86 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2380  O-methyltransferase family protein  36.86 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2385  O-methyltransferase family protein  36.86 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4338  O-methyltransferase family 3  34.45 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.209167 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6637  O-methyltransferase family protein  33.9 
 
 
238 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635132  normal  0.124721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1386  putative O-methyltransferase  37.5 
 
 
238 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03260  conserved hypothetical protein  37.14 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0145288  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03236  O-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01830)  32.31 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.659946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37960  O-methyltransferase  39.06 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2172  O-methyltransferase family 3  39.2 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0521559  normal  0.503849 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2447  O-methyltransferase family 3  36.8 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3101  O-methyltransferase family 3  32.21 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2978  O-methyltransferase family protein  31.85 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3277  O-methyltransferase family protein  32.03 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0904  O-methyltransferase family 3  30.12 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0279  O-methyltransferase family 3  32.28 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0966  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  31.79 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.306907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3051  O-methyltransferase family 3  36.57 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0755  O-methyltransferase family protein  26.26 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.078577 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2155  O-methyltransferase family 3  29.79 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261573  normal  0.370065 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0209  O-methyltransferase family 3  25.42 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3189  Caffeoyl-CoA O-methyltransferase  34.59 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.873252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4077  O-methyltransferase family protein  31.54 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00728194  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4298  O-methyltransferase family protein  38.46 
 
 
221 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4649  O-methyltransferase family 3  41.18 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64073  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10188  O-methyltransferase  42.57 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.153182  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13360  predicted O-methyltransferase  37.04 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.693653  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2823  O-methyltransferase family 3  30.16 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1444  O-methyltransferase family protein  29.41 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2832  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  36.23 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1933  O-methyltransferase family protein  41.58 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.744837  hitchhiker  0.0000011489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1798  O-methyltransferase family protein  30.99 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420384  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0664  O-methyltransferase family 3  38.06 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4693  O-methyltransferase family 3  33.57 
 
 
204 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555176  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0299  O-methyltransferase family 3  27.48 
 
 
211 aa  62.4  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1827  O-methyltransferase family protein  35.61 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4391  O-methyltransferase family 3  27.07 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000075162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2965  O-methyltransferase family protein  33.85 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2512  O-methyltransferase family 3  31.62 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0739211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05830  O-methyltransferase family 3  30.58 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00143828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2932  O-methyltransferase family 3  28.79 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0268348  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2619  O-methyltransferase family protein  29.08 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.182241  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2066  O-methyltransferase  34.85 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000833966  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0193  O-methyltransferase family 3  34.31 
 
 
222 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2853  O-methyltransferase family 3  26.09 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0900175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2045  O-methyltransferase, putative  34.09 
 
 
223 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0144  O-methyltransferase family protein  33.59 
 
 
221 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0960801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0153  O-methyltransferase family protein  33.59 
 
 
221 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2490  O-methyltransferase family protein  30.47 
 
 
194 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000302864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0629  O-methyltransferase family 3  28.32 
 
 
219 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00645598  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0923  O-methyltransferase family 3  28.8 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2474  O-methyltransferase family protein  30.47 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2897  O-methyltransferase family 3  29.75 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.262328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0134  O-methyltransferase family protein  33.59 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.670922  normal  0.26374 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02207  O-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06990)  30.46 
 
 
279 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.886788  normal  0.899254 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2286  O-methyltransferase family protein  30.47 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.874989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2249  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  30.47 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.387556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4230  O-methyltransferase family protein  30.58 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0620204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2457  O-methyltransferase family protein  30.47 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.286114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8039  O-methyltransferase  31.85 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.957053  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2265  O-methyltransferase family protein  30.47 
 
 
208 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0648582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3096  O-methyltransferase family protein  28.89 
 
 
213 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0192403  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1627  O-methyltransferase family 3  37.59 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0333  O-methyltransferase family protein  38.83 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1190  O-methyltransferase family 3  27.97 
 
 
209 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1009  O-methyltransferase family protein  31.25 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.898528  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01450  predicted O-methyltransferase  32.87 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.580973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0514  O-methyltransferase family protein  35 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437262  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0733  O-methyltransferase family protein  30.58 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00127243  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4503  O-methyltransferase family protein  30.58 
 
 
213 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.98253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2554  O-methyltransferase family protein  29.69 
 
 
194 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.527603  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5032  O-methyltransferase family protein  40.7 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404122  normal  0.657554 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1785  O-methyltransferase family protein  29.69 
 
 
196 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.941748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2207  caffeoyl-CoA O-methyltransferase  29.69 
 
 
197 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0584641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2917  O-methyltransferase family protein  28.12 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18598 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03537  catecholamine-O-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00150)  27.39 
 
 
269 aa  55.5  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  32.95 
 
 
494 aa  55.1  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>