More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3411 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3411  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 		 341 aa  687    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0749603  normal  0.0972256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0378  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  84.71 
 
 		 327 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1916  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  75.23 
 
 		 327 aa  511  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5755  putative alcohol dehydrogenase  73.09 
 
 		 329 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00880  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  74.31 
 
 		 327 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0909  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  72.56 
 
 		 328 aa  471  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.543563  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4206  alcohol dehydrogenase  72.17 
 
 		 327 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1061  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  68.5 
 
 		 327 aa  461  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215754  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1026  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  68.5 
 
 		 327 aa  461  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1118  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  70.21 
 
 		 329 aa  458  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.439125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2614  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  66.67 
 
 		 327 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2263  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  65.44 
 
 		 328 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2010  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  66.67 
 
 		 327 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3463  alcohol dehydrogenase  65.87 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0046  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  64.53 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0056  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  65.34 
 
 		 329 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5387  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  66.67 
 
 		 326 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0426  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.53 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4482  alcohol dehydrogenase  60.12 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  63.41 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3003  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.47 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.47 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00520029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1412  alcohol dehydrogenase  62.28 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0778  alcohol dehydrogenase  61.09 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5774  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  62.88 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6106  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  65.75 
 
 		 326 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5710  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.9 
 
 		 328 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.39 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  63.91 
 
 		 327 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1418  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.3 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1844  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.12 
 
 		 328 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.364019  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2442  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  63.61 
 
 		 327 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4570  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.51 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0690283  normal  0.180174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0116  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.54 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4437  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.51 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6316  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.69 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2088  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.51 
 
 		 335 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.51 
 
 		 335 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0255685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4279  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60 
 
 		 329 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3811  alcohol dehydrogenase  60.31 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.367901  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3850  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.75 
 
 		 324 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1505  alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  61.85 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  60.74 
 
 		 332 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0573  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.96 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.526868  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5905  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.08 
 
 		 329 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.22496 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0459  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.39 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4710  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.27 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2748  putative oxidoreductase  61.77 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2296  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277676  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1333  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.47 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2605  putative oxidoreductase  61.47 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0163  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.47 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2558  hypothetical protein  55.52 
 
 		 328 aa  371  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2413  hypothetical protein  55.52 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1018  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.47 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0189  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.47 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4129  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  58.72 
 
 		 328 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2299  alcohol dehydrogenase  58.48 
 
 		 334 aa  363  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5373  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.88 
 
 		 331 aa  353  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1201  putative alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  56.53 
 
 		 329 aa  348  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.15 
 
 		 331 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.66 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1192  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.6 
 
 		 332 aa  305  6e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0303  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.73 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0138  alcohol dehydrogenase  47.32 
 
 		 337 aa  288  9e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0343  alcohol dehydrogenase  49.22 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2709  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.9 
 
 		 334 aa  279  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0829  alcohol dehydrogenase  45.05 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1805  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  49.84 
 
 		 332 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.77 
 
 		 323 aa  275  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2022  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  49.55 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000478739  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0264  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.8 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4103  putative alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 		 332 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.409258  normal  0.240324 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1330  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  44.21 
 
 		 380 aa  266  4e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3343  alcohol dehydrogenase  48.59 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0866379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6571  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  44.9 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3073  alcohol dehydrogenase  48.28 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11890  alcohol dehydrogenase adhA  46.44 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.594038 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0630  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  38.3 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1124  alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1096  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.81 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1113  alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0775  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.14 
 
 		 342 aa  223  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0181  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase (ADH-HT). oxidoreductase protein  59.34 
 
 		 188 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103574 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.96 
 
 		 338 aa  198  9e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1084  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  36.97 
 
 		 342 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31  normal  0.438887 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.61 
 
 		 342 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.12 
 
 		 342 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1193  alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.24 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  34.52 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.32 
 
 		 344 aa  167  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.32 
 
 		 344 aa  167  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>