91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0542 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0542  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  345  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0539  hypothetical protein  78.92 
 
 		 166 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4411  protein of unknown function DUF29  49.62 
 
 		 270 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3729  protein of unknown function DUF29  43.41 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3699  hypothetical protein  43.88 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.374483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2482  protein of unknown function DUF29  44.93 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0170652 
 
 
-
 
NC_009474  Acry_3636  hypothetical protein  41.3 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4999  hypothetical protein  40.31 
 
 		 145 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3625  hypothetical protein  39.13 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3241  protein of unknown function DUF29  36.81 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.249361 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3739  hypothetical protein  38.93 
 
 		 143 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3152  protein of unknown function DUF29  34.78 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.039053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2944  protein of unknown function DUF29  34.78 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2766  hypothetical protein  37.4 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0580  hypothetical protein  37.23 
 
 		 144 aa  101  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00000165262  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0698  protein of unknown function DUF29  35.04 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213059  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1246  protein of unknown function DUF29  36.51 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2916  protein of unknown function DUF29  42.54 
 
 		 145 aa  97.4  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1277  protein of unknown function DUF29  35.71 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4304  protein of unknown function DUF29  36.15 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4036  hypothetical protein  41.03 
 
 		 144 aa  94.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0651  protein of unknown function DUF29  31.85 
 
 		 152 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0154198  normal  0.0872929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4105  protein of unknown function DUF29  34.65 
 
 		 148 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0622  protein of unknown function DUF29  41.41 
 
 		 145 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1841  protein of unknown function DUF29  36.51 
 
 		 152 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1318  protein of unknown function DUF29  29.93 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5306  protein of unknown function DUF29  30.34 
 
 		 150 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3570  hypothetical protein  44.44 
 
 		 147 aa  88.6  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0766  hypothetical protein  35.9 
 
 		 147 aa  87  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000028887  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0704  protein of unknown function DUF29  34.13 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  0.581581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3967  protein of unknown function DUF29  35.04 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3205  protein of unknown function DUF29  32.54 
 
 		 146 aa  84  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4365  protein of unknown function DUF29  32.31 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0780275 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1894  hypothetical protein  38.1 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0255  protein of unknown function DUF29  30.82 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2917  protein of unknown function DUF29  31.5 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2756  protein of unknown function DUF29  26.21 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1360  protein of unknown function DUF29  32.28 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0548  protein of unknown function DUF29  34.26 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5336  protein of unknown function DUF29  27.48 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4913  protein of unknown function DUF29  28.67 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.576904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1364  protein of unknown function DUF29  28.46 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1710  protein of unknown function DUF29  31.58 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000133374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5335  protein of unknown function DUF29  37.35 
 
 		 104 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2442  protein of unknown function DUF29  30.36 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257531  normal  0.205428 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1459  protein of unknown function DUF29  32.41 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000787671  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5034  hypothetical protein  27.4 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1741  protein of unknown function DUF29  30.56 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2239  protein of unknown function DUF29  29.23 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707792 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1266  protein of unknown function DUF29  32.41 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3661  protein of unknown function DUF29  24.81 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216032  normal  0.996648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0845  protein of unknown function DUF29  27.86 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.275216 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3727  protein of unknown function DUF29  28.46 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2472  protein of unknown function DUF29  30 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0330684  normal  0.567998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3642  protein of unknown function DUF29  30 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1740  protein of unknown function DUF29  30.56 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1267  protein of unknown function DUF29  30.97 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1237  protein of unknown function DUF29  34.26 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1900  protein of unknown function DUF29  30.33 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1914  hypothetical protein  37.7 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1924  protein of unknown function DUF29  30.33 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.319193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0809  protein of unknown function DUF29  27.43 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0838  protein of unknown function DUF29  27.43 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1408  protein of unknown function DUF29  26.47 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.835091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0216  protein of unknown function DUF29  23.81 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0213  protein of unknown function DUF29  23.81 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000762882  decreased coverage  0.000484269 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1808  hypothetical protein  28.75 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0944  protein of unknown function DUF29  29.01 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0971  protein of unknown function DUF29  29.01 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000575835  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2565  protein of unknown function DUF29  28.47 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0389  protein of unknown function DUF29  24.24 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0380  protein of unknown function DUF29  24.24 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1919  protein of unknown function DUF29  25.93 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.891607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0890  protein of unknown function DUF29  25 
 
 		 135 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1050  protein of unknown function DUF29  25.58 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0264993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3342  protein of unknown function DUF29  23.53 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0602  protein of unknown function DUF29  26.52 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1418  protein of unknown function DUF29  24.62 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0014  protein of unknown function DUF29  24.62 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0013  protein of unknown function DUF29  26.12 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1378  protein of unknown function DUF29  26.03 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1918  protein of unknown function DUF29  26.43 
 
 		 131 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3691  protein of unknown function DUF29  28.38 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2489  hypothetical protein  26.37 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000894526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3729  protein of unknown function DUF29  24.63 
 
 		 131 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3745  protein of unknown function DUF29  27.03 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1533  protein of unknown function DUF29  23.61 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1506  protein of unknown function DUF29  23.61 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2146  protein of unknown function DUF29  22.86 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3658  protein of unknown function DUF29  25.53 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1384  protein of unknown function DUF29  31.67 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>