31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2489 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2489  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  191  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000894526 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0766  hypothetical protein  39.77 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000028887  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0698  protein of unknown function DUF29  37.65 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213059  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3205  protein of unknown function DUF29  34.07 
 
 
146 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2917  protein of unknown function DUF29  32.97 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0975429  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3699  hypothetical protein  35.16 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.374483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5306  protein of unknown function DUF29  31.82 
 
 
150 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4411  protein of unknown function DUF29  34.07 
 
 
270 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2756  protein of unknown function DUF29  30.77 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1841  protein of unknown function DUF29  34.15 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3625  hypothetical protein  34.07 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3729  protein of unknown function DUF29  33.33 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1277  protein of unknown function DUF29  33.33 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2482  protein of unknown function DUF29  35 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0170652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1894  hypothetical protein  37.36 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4913  protein of unknown function DUF29  32.98 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.576904 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2944  protein of unknown function DUF29  34.52 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1246  protein of unknown function DUF29  32.18 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3152  protein of unknown function DUF29  34.52 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.039053  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0539  hypothetical protein  29.67 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0542  hypothetical protein  26.37 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4999  hypothetical protein  34.67 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0622  protein of unknown function DUF29  34.57 
 
 
145 aa  44.3  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4304  protein of unknown function DUF29  30.77 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4036  hypothetical protein  37.8 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3739  hypothetical protein  31.82 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009474  Acry_3636  hypothetical protein  32.18 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3661  protein of unknown function DUF29  34.07 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216032  normal  0.996648 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1808  hypothetical protein  36.67 
 
 
105 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0704  protein of unknown function DUF29  32.14 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  0.581581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0651  protein of unknown function DUF29  33.78 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0154198  normal  0.0872929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>