99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4999 on replicon NC_008763
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008763  Pnap_4999  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  291  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4036  hypothetical protein  54.55 
 
 
144 aa  161  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0622  protein of unknown function DUF29  52.82 
 
 
145 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009474  Acry_3636  hypothetical protein  48.95 
 
 
146 aa  137  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3729  protein of unknown function DUF29  46.21 
 
 
143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0651  protein of unknown function DUF29  45 
 
 
152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0154198  normal  0.0872929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3241  protein of unknown function DUF29  43.97 
 
 
161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.249361 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3739  hypothetical protein  43.45 
 
 
143 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1277  protein of unknown function DUF29  37.93 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1246  protein of unknown function DUF29  38.62 
 
 
158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0539  hypothetical protein  43.7 
 
 
166 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2766  hypothetical protein  42.14 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3625  hypothetical protein  45.07 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0542  hypothetical protein  40.31 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3205  protein of unknown function DUF29  40.14 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0698  protein of unknown function DUF29  39.16 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213059  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2916  protein of unknown function DUF29  46.1 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1894  hypothetical protein  40.69 
 
 
145 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2944  protein of unknown function DUF29  36.5 
 
 
147 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3152  protein of unknown function DUF29  36.5 
 
 
147 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.039053  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2917  protein of unknown function DUF29  38.1 
 
 
146 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0975429  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0580  hypothetical protein  39.72 
 
 
144 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00000165262  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3967  protein of unknown function DUF29  42.07 
 
 
149 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4411  protein of unknown function DUF29  40.71 
 
 
270 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0704  protein of unknown function DUF29  36.36 
 
 
153 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  0.581581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1841  protein of unknown function DUF29  40.43 
 
 
152 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0255  protein of unknown function DUF29  32.24 
 
 
157 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4304  protein of unknown function DUF29  35.29 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2482  protein of unknown function DUF29  37.78 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0170652 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3570  hypothetical protein  41.84 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5306  protein of unknown function DUF29  36.23 
 
 
150 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2756  protein of unknown function DUF29  33.09 
 
 
159 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3699  hypothetical protein  36.62 
 
 
164 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.374483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0766  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000028887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5336  protein of unknown function DUF29  31.25 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4913  protein of unknown function DUF29  31.58 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.576904 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1914  hypothetical protein  54.55 
 
 
68 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4105  protein of unknown function DUF29  34.88 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4365  protein of unknown function DUF29  32.35 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0780275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0845  protein of unknown function DUF29  33.8 
 
 
235 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.275216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1360  protein of unknown function DUF29  32.17 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5034  hypothetical protein  28.95 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1364  protein of unknown function DUF29  31.29 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1318  protein of unknown function DUF29  26.95 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2239  protein of unknown function DUF29  30.41 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0838  protein of unknown function DUF29  31.34 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0809  protein of unknown function DUF29  31.34 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5335  protein of unknown function DUF29  38.68 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0380  protein of unknown function DUF29  29.25 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0389  protein of unknown function DUF29  29.25 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0944  protein of unknown function DUF29  30.41 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0971  protein of unknown function DUF29  30.41 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000575835  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2472  protein of unknown function DUF29  29.05 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0330684  normal  0.567998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3642  protein of unknown function DUF29  29.05 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1740  protein of unknown function DUF29  30.67 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166584  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3661  protein of unknown function DUF29  30.07 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216032  normal  0.996648 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1741  protein of unknown function DUF29  30.43 
 
 
174 aa  67  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3342  protein of unknown function DUF29  31.25 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3727  protein of unknown function DUF29  29.45 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2442  protein of unknown function DUF29  27.08 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257531  normal  0.205428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1710  protein of unknown function DUF29  29.25 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000133374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1408  protein of unknown function DUF29  31.16 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.835091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0216  protein of unknown function DUF29  29.32 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0213  protein of unknown function DUF29  29.32 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000762882  decreased coverage  0.000484269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0890  protein of unknown function DUF29  28.37 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1924  protein of unknown function DUF29  29.25 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.319193  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1459  protein of unknown function DUF29  26.8 
 
 
173 aa  62  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000787671  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1900  protein of unknown function DUF29  28.57 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3658  protein of unknown function DUF29  30.21 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1418  protein of unknown function DUF29  26.9 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1919  protein of unknown function DUF29  25.85 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.891607 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0548  protein of unknown function DUF29  28.48 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1808  hypothetical protein  32.05 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1267  protein of unknown function DUF29  27.04 
 
 
170 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4927  protein of unknown function DUF29  34.13 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1050  protein of unknown function DUF29  24.49 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0264993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0013  protein of unknown function DUF29  28.26 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0602  protein of unknown function DUF29  26.57 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0014  protein of unknown function DUF29  27.41 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1237  protein of unknown function DUF29  26.45 
 
 
172 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0100  protein of unknown function DUF29  28.77 
 
 
151 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0935689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3208  hypothetical protein  30.92 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1596  protein of unknown function DUF29  27.59 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00472481 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1266  protein of unknown function DUF29  27.16 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1533  protein of unknown function DUF29  26.43 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1506  protein of unknown function DUF29  26.43 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1918  protein of unknown function DUF29  26.09 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1378  protein of unknown function DUF29  29.14 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3729  protein of unknown function DUF29  24.46 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2489  hypothetical protein  34.67 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000894526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1384  protein of unknown function DUF29  30.56 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3691  protein of unknown function DUF29  32.81 
 
 
137 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3745  protein of unknown function DUF29  24.29 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3741  protein of unknown function DUF29  25.17 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3972  protein of unknown function DUF29  28 
 
 
146 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2565  protein of unknown function DUF29  23.53 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2146  protein of unknown function DUF29  30.77 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2916  protein of unknown function DUF29  31.82 
 
 
71 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0704921  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0010  protein of unknown function DUF29  32.45 
 
 
171 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>