95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0539 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0539  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  344  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0542  hypothetical protein  78.92 
 
 		 166 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4411  protein of unknown function DUF29  51.13 
 
 		 270 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3699  hypothetical protein  42.48 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.374483 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3729  protein of unknown function DUF29  44.96 
 
 		 143 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2482  protein of unknown function DUF29  44.29 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0170652 
 
 
-
 
NC_009474  Acry_3636  hypothetical protein  42.22 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4999  hypothetical protein  43.7 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3241  protein of unknown function DUF29  39.33 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.249361 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3625  hypothetical protein  42.65 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3739  hypothetical protein  40.91 
 
 		 143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2766  hypothetical protein  40.15 
 
 		 144 aa  104  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0698  protein of unknown function DUF29  37.59 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213059  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3152  protein of unknown function DUF29  34.97 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.039053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2944  protein of unknown function DUF29  34.97 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0580  hypothetical protein  39.37 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00000165262  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1277  protein of unknown function DUF29  36.51 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1246  protein of unknown function DUF29  36.51 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4304  protein of unknown function DUF29  36.8 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4036  hypothetical protein  42.74 
 
 		 144 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0622  protein of unknown function DUF29  45.74 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0704  protein of unknown function DUF29  37.12 
 
 		 153 aa  91.3  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  0.581581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2916  protein of unknown function DUF29  41.48 
 
 		 145 aa  91.3  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4105  protein of unknown function DUF29  34.65 
 
 		 148 aa  90.9  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3967  protein of unknown function DUF29  38.97 
 
 		 149 aa  90.5  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104438 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0651  protein of unknown function DUF29  33.33 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0154198  normal  0.0872929 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1841  protein of unknown function DUF29  34.56 
 
 		 152 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3570  hypothetical protein  46.83 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1318  protein of unknown function DUF29  31.82 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5306  protein of unknown function DUF29  34.78 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0766  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  87.8  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000028887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0255  protein of unknown function DUF29  35.57 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3205  protein of unknown function DUF29  33.07 
 
 		 146 aa  84.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2917  protein of unknown function DUF29  32.28 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1894  hypothetical protein  38.35 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4365  protein of unknown function DUF29  32.8 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0780275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2756  protein of unknown function DUF29  29.71 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5336  protein of unknown function DUF29  30.3 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2442  protein of unknown function DUF29  33.61 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257531  normal  0.205428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1360  protein of unknown function DUF29  33.33 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5335  protein of unknown function DUF29  38.2 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1364  protein of unknown function DUF29  32.52 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3642  protein of unknown function DUF29  32.12 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2472  protein of unknown function DUF29  32.12 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0330684  normal  0.567998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2239  protein of unknown function DUF29  31.39 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1710  protein of unknown function DUF29  32.37 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000133374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3661  protein of unknown function DUF29  30.53 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216032  normal  0.996648 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1741  protein of unknown function DUF29  30.67 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185982  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1740  protein of unknown function DUF29  30.67 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0548  protein of unknown function DUF29  29.33 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0845  protein of unknown function DUF29  31.21 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.275216 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3727  protein of unknown function DUF29  30.51 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5034  hypothetical protein  28.48 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4913  protein of unknown function DUF29  28.47 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.576904 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1237  protein of unknown function DUF29  29.09 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1459  protein of unknown function DUF29  33.33 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000787671  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1900  protein of unknown function DUF29  32.59 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1924  protein of unknown function DUF29  32.59 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.319193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1050  protein of unknown function DUF29  27.21 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0264993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1408  protein of unknown function DUF29  27.94 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.835091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0380  protein of unknown function DUF29  26.21 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0389  protein of unknown function DUF29  26.21 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1266  protein of unknown function DUF29  28.67 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1808  hypothetical protein  32 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1267  protein of unknown function DUF29  29.5 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0971  protein of unknown function DUF29  31.5 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000575835  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0944  protein of unknown function DUF29  31.5 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0602  protein of unknown function DUF29  29.17 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0890  protein of unknown function DUF29  25.93 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0216  protein of unknown function DUF29  25.4 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0213  protein of unknown function DUF29  25.4 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000762882  decreased coverage  0.000484269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3342  protein of unknown function DUF29  28.1 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0838  protein of unknown function DUF29  27.19 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1914  hypothetical protein  38.71 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1418  protein of unknown function DUF29  25.52 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0809  protein of unknown function DUF29  27.19 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0014  protein of unknown function DUF29  28.15 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1506  protein of unknown function DUF29  27.08 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1533  protein of unknown function DUF29  27.08 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1919  protein of unknown function DUF29  25.18 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.891607 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1378  protein of unknown function DUF29  27.81 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3729  protein of unknown function DUF29  24.44 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0013  protein of unknown function DUF29  27.74 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2565  protein of unknown function DUF29  27.74 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3972  protein of unknown function DUF29  29.37 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0100  protein of unknown function DUF29  28.15 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0935689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1918  protein of unknown function DUF29  27.21 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2146  protein of unknown function DUF29  25 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2489  hypothetical protein  29.67 
 
 		 91 aa  45.1  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000894526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1384  protein of unknown function DUF29  27.91 
 
 		 102 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3745  protein of unknown function DUF29  24.64 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3691  protein of unknown function DUF29  24.64 
 
 		 137 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3658  protein of unknown function DUF29  25 
 
 		 104 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1596  protein of unknown function DUF29  28.26 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00472481 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0144  protein of unknown function DUF29  31.34 
 
 		 148 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42277  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>