103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1408 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1408  protein of unknown function DUF29  100 
 
 
135 aa  273  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.835091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0014  protein of unknown function DUF29  75.56 
 
 
135 aa  210  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3972  protein of unknown function DUF29  64.14 
 
 
146 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1378  protein of unknown function DUF29  63.38 
 
 
146 aa  179  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1918  protein of unknown function DUF29  53.12 
 
 
131 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1412  protein of unknown function DUF29  62.04 
 
 
122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.516954  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3745  protein of unknown function DUF29  43.08 
 
 
137 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1506  protein of unknown function DUF29  43.41 
 
 
151 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1533  protein of unknown function DUF29  43.41 
 
 
151 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1562  protein of unknown function DUF29  42.54 
 
 
133 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.357579 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0013  protein of unknown function DUF29  43.94 
 
 
135 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3691  protein of unknown function DUF29  42.31 
 
 
137 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1988  protein of unknown function DUF29  41.67 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2565  protein of unknown function DUF29  39.13 
 
 
151 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2015  protein of unknown function DUF29  40.74 
 
 
152 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.298519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2239  protein of unknown function DUF29  41.35 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0144  protein of unknown function DUF29  37.21 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42277  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0148  protein of unknown function DUF29  37.21 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3642  protein of unknown function DUF29  40.6 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2472  protein of unknown function DUF29  40.6 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0330684  normal  0.567998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3729  protein of unknown function DUF29  36.84 
 
 
131 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1919  protein of unknown function DUF29  36.64 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.891607 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0944  protein of unknown function DUF29  35.97 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2146  protein of unknown function DUF29  35.11 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0971  protein of unknown function DUF29  35.97 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000575835  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2482  protein of unknown function DUF29  35.77 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0170652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2442  protein of unknown function DUF29  38.52 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257531  normal  0.205428 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1924  protein of unknown function DUF29  37.04 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.319193  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1710  protein of unknown function DUF29  36.57 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000133374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1900  protein of unknown function DUF29  36.3 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2917  protein of unknown function DUF29  32.09 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0975429  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0255  protein of unknown function DUF29  35.66 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0809  protein of unknown function DUF29  33.83 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0838  protein of unknown function DUF29  33.83 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009474  Acry_3636  hypothetical protein  29.29 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3205  protein of unknown function DUF29  31.11 
 
 
146 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3727  protein of unknown function DUF29  39.29 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1360  protein of unknown function DUF29  36.3 
 
 
165 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0533  protein of unknown function DUF29  36.67 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2766  hypothetical protein  33.08 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2944  protein of unknown function DUF29  30.22 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0890  protein of unknown function DUF29  31.3 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3152  protein of unknown function DUF29  30.22 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.039053  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3729  protein of unknown function DUF29  36.09 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4999  hypothetical protein  31.16 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1418  protein of unknown function DUF29  32.58 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1841  protein of unknown function DUF29  34.53 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3625  hypothetical protein  29.58 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4105  protein of unknown function DUF29  33.05 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1277  protein of unknown function DUF29  33.07 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5306  protein of unknown function DUF29  32.84 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0580  hypothetical protein  28.89 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00000165262  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1237  protein of unknown function DUF29  30.87 
 
 
172 aa  62.8  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3739  hypothetical protein  32.12 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4411  protein of unknown function DUF29  30.15 
 
 
270 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0548  protein of unknown function DUF29  27.52 
 
 
170 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1246  protein of unknown function DUF29  32.28 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0380  protein of unknown function DUF29  32.09 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4913  protein of unknown function DUF29  32.65 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.576904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0389  protein of unknown function DUF29  32.09 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0704  protein of unknown function DUF29  34.59 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  0.581581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3661  protein of unknown function DUF29  34.45 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216032  normal  0.996648 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1459  protein of unknown function DUF29  28.19 
 
 
173 aa  60.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000787671  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4304  protein of unknown function DUF29  31.58 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3342  protein of unknown function DUF29  30 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1894  hypothetical protein  32.14 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0539  hypothetical protein  27.94 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1050  protein of unknown function DUF29  30.83 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0264993 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0651  protein of unknown function DUF29  33.58 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0154198  normal  0.0872929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1364  protein of unknown function DUF29  34.45 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1125  hypothetical protein  31.3 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3967  protein of unknown function DUF29  31.58 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3241  protein of unknown function DUF29  31.11 
 
 
161 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.249361 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1741  protein of unknown function DUF29  26.67 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1596  protein of unknown function DUF29  30.83 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00472481 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0698  protein of unknown function DUF29  35.96 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213059  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0542  hypothetical protein  26.47 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3658  protein of unknown function DUF29  34.69 
 
 
104 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4927  protein of unknown function DUF29  31.4 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612611 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0622  protein of unknown function DUF29  30.22 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1318  protein of unknown function DUF29  29.69 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4365  protein of unknown function DUF29  29.32 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0780275 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1266  protein of unknown function DUF29  27.56 
 
 
173 aa  51.6  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0845  protein of unknown function DUF29  28.78 
 
 
235 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.275216 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5034  hypothetical protein  29.93 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4036  hypothetical protein  30.6 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3741  protein of unknown function DUF29  35.34 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1267  protein of unknown function DUF29  27.81 
 
 
170 aa  50.1  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0602  protein of unknown function DUF29  28.97 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3208  hypothetical protein  28.57 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5336  protein of unknown function DUF29  29.41 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2916  protein of unknown function DUF29  29.08 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0010  protein of unknown function DUF29  26.53 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3699  hypothetical protein  27.34 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.374483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0100  protein of unknown function DUF29  28.47 
 
 
151 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0935689 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1740  protein of unknown function DUF29  26.67 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166584  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0216  protein of unknown function DUF29  27.78 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0213  protein of unknown function DUF29  27.78 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000762882  decreased coverage  0.000484269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1401  protein of unknown function DUF29  39.08 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1384  protein of unknown function DUF29  32.14 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>