55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5335 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5335  protein of unknown function DUF29  100 
 
 
104 aa  212  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4304  protein of unknown function DUF29  59.18 
 
 
142 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0704  protein of unknown function DUF29  55.67 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  0.581581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4365  protein of unknown function DUF29  56.12 
 
 
142 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0780275 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3152  protein of unknown function DUF29  52 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.039053  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2944  protein of unknown function DUF29  52 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1277  protein of unknown function DUF29  50 
 
 
158 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1246  protein of unknown function DUF29  50 
 
 
158 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1318  protein of unknown function DUF29  48.54 
 
 
157 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0698  protein of unknown function DUF29  48.08 
 
 
150 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213059  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5336  protein of unknown function DUF29  51.02 
 
 
144 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3967  protein of unknown function DUF29  48.54 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5306  protein of unknown function DUF29  44 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0580  hypothetical protein  39.42 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00000165262  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3241  protein of unknown function DUF29  45.36 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.249361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0651  protein of unknown function DUF29  44.23 
 
 
152 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0154198  normal  0.0872929 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2766  hypothetical protein  46.15 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2756  protein of unknown function DUF29  41.18 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3625  hypothetical protein  33.01 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347461  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4999  hypothetical protein  38.68 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009474  Acry_3636  hypothetical protein  35.58 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0539  hypothetical protein  38.2 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3205  protein of unknown function DUF29  34.62 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2917  protein of unknown function DUF29  34.62 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0975429  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3729  protein of unknown function DUF29  32.69 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4105  protein of unknown function DUF29  33.66 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0542  hypothetical protein  37.35 
 
 
166 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2482  protein of unknown function DUF29  36.59 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0170652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0766  hypothetical protein  34.91 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000028887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4036  hypothetical protein  33.02 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1360  protein of unknown function DUF29  37 
 
 
165 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0622  protein of unknown function DUF29  36.19 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4411  protein of unknown function DUF29  34.83 
 
 
270 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5034  hypothetical protein  31.25 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1894  hypothetical protein  36.14 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2916  protein of unknown function DUF29  36.14 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0255  protein of unknown function DUF29  33.04 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3739  hypothetical protein  31.25 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3699  hypothetical protein  30 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.374483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3727  protein of unknown function DUF29  33.02 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4913  protein of unknown function DUF29  33.93 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.576904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3661  protein of unknown function DUF29  31.13 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216032  normal  0.996648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1364  protein of unknown function DUF29  32.08 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1841  protein of unknown function DUF29  28.85 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2442  protein of unknown function DUF29  27.1 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257531  normal  0.205428 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3570  hypothetical protein  32.53 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0809  protein of unknown function DUF29  29.03 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0838  protein of unknown function DUF29  29.03 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0602  protein of unknown function DUF29  29.25 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3342  protein of unknown function DUF29  32.93 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0845  protein of unknown function DUF29  28.42 
 
 
235 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.275216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1050  protein of unknown function DUF29  30.68 
 
 
150 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0264993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0100  protein of unknown function DUF29  51.16 
 
 
151 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0935689 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0216  protein of unknown function DUF29  27.17 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0213  protein of unknown function DUF29  27.17 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000762882  decreased coverage  0.000484269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>