110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3570 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3570  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  300  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009474  Acry_3636  hypothetical protein  57.24 
 
 
146 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2916  protein of unknown function DUF29  60 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3625  hypothetical protein  50.68 
 
 
148 aa  157  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347461  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0580  hypothetical protein  50.71 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00000165262  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3729  protein of unknown function DUF29  46.76 
 
 
143 aa  144  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3739  hypothetical protein  47.48 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2766  hypothetical protein  44.29 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0651  protein of unknown function DUF29  39.58 
 
 
152 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0154198  normal  0.0872929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2482  protein of unknown function DUF29  46.32 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0170652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3241  protein of unknown function DUF29  40.43 
 
 
161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.249361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1277  protein of unknown function DUF29  38.69 
 
 
158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0766  hypothetical protein  42.14 
 
 
147 aa  118  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000028887  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0539  hypothetical protein  46.83 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4999  hypothetical protein  41.84 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2944  protein of unknown function DUF29  37.68 
 
 
147 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3152  protein of unknown function DUF29  37.68 
 
 
147 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.039053  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0542  hypothetical protein  44.44 
 
 
166 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4036  hypothetical protein  41.84 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1246  protein of unknown function DUF29  38.69 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0622  protein of unknown function DUF29  39.46 
 
 
145 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3967  protein of unknown function DUF29  41.01 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4411  protein of unknown function DUF29  42.07 
 
 
270 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3205  protein of unknown function DUF29  37.76 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0704  protein of unknown function DUF29  37.06 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  0.581581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2917  protein of unknown function DUF29  37.76 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0975429  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0698  protein of unknown function DUF29  37.14 
 
 
150 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213059  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4304  protein of unknown function DUF29  35.56 
 
 
142 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5336  protein of unknown function DUF29  34.04 
 
 
144 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1841  protein of unknown function DUF29  36.73 
 
 
152 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1894  hypothetical protein  38.13 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1459  protein of unknown function DUF29  31.87 
 
 
173 aa  95.1  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000787671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4913  protein of unknown function DUF29  32.9 
 
 
158 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.576904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3699  hypothetical protein  35.34 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.374483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2756  protein of unknown function DUF29  30.5 
 
 
159 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5306  protein of unknown function DUF29  32.35 
 
 
150 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4365  protein of unknown function DUF29  31.11 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0780275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4105  protein of unknown function DUF29  31.72 
 
 
148 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0809  protein of unknown function DUF29  37.69 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0255  protein of unknown function DUF29  31.82 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0845  protein of unknown function DUF29  33.11 
 
 
235 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.275216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0838  protein of unknown function DUF29  37.69 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1318  protein of unknown function DUF29  28.57 
 
 
157 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5034  hypothetical protein  32.21 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0380  protein of unknown function DUF29  31.25 
 
 
155 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0389  protein of unknown function DUF29  31.25 
 
 
155 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2442  protein of unknown function DUF29  34.27 
 
 
155 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257531  normal  0.205428 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0548  protein of unknown function DUF29  28.39 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3342  protein of unknown function DUF29  33.57 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1740  protein of unknown function DUF29  32.26 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1741  protein of unknown function DUF29  30.97 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1914  hypothetical protein  60.66 
 
 
68 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1266  protein of unknown function DUF29  30.19 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1267  protein of unknown function DUF29  32.26 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2565  protein of unknown function DUF29  35.46 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3727  protein of unknown function DUF29  32.17 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5335  protein of unknown function DUF29  32.69 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0602  protein of unknown function DUF29  30.99 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1237  protein of unknown function DUF29  28.39 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0216  protein of unknown function DUF29  31.54 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0213  protein of unknown function DUF29  31.54 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000762882  decreased coverage  0.000484269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0014  protein of unknown function DUF29  30.71 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1562  protein of unknown function DUF29  34.81 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.357579 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0013  protein of unknown function DUF29  30.15 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3661  protein of unknown function DUF29  29.86 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216032  normal  0.996648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1050  protein of unknown function DUF29  28.67 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0264993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1364  protein of unknown function DUF29  28.47 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1919  protein of unknown function DUF29  28.87 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.891607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1360  protein of unknown function DUF29  27.4 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1710  protein of unknown function DUF29  28.67 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000133374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2239  protein of unknown function DUF29  28.87 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1418  protein of unknown function DUF29  26.95 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3642  protein of unknown function DUF29  28.67 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0100  protein of unknown function DUF29  31.47 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0935689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3745  protein of unknown function DUF29  33.82 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2472  protein of unknown function DUF29  28.67 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0330684  normal  0.567998 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1808  hypothetical protein  35.06 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1408  protein of unknown function DUF29  28.06 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.835091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1988  protein of unknown function DUF29  31.11 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3691  protein of unknown function DUF29  30.37 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3972  protein of unknown function DUF29  31.47 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2146  protein of unknown function DUF29  28.89 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0890  protein of unknown function DUF29  25.74 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1378  protein of unknown function DUF29  31.69 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0944  protein of unknown function DUF29  27.46 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0971  protein of unknown function DUF29  27.46 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000575835  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2015  protein of unknown function DUF29  30.37 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.298519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0144  protein of unknown function DUF29  29.63 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42277  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3729  protein of unknown function DUF29  27.74 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3658  protein of unknown function DUF29  33.72 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0201  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  57.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0148  protein of unknown function DUF29  29.63 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1900  protein of unknown function DUF29  27.97 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1506  protein of unknown function DUF29  29.1 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1533  protein of unknown function DUF29  29.1 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1596  protein of unknown function DUF29  27.97 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00472481 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1924  protein of unknown function DUF29  27.97 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.319193  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1918  protein of unknown function DUF29  25.56 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3208  hypothetical protein  34.17 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2498  protein of unknown function DUF29  24.14 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>