17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2770 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2770  tail fiber domain-containing protein  100 
 
 
367 aa  728  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00369502  normal  0.0266249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2092  tail fiber domain protein  61.36 
 
 
475 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4038  tail fiber domain protein  61.36 
 
 
475 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3936  tail fiber domain protein  82.24 
 
 
332 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0787  tail fiber protein  30.31 
 
 
349 aa  142  1e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08310  hypothetical protein  35.96 
 
 
350 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  3.14349e-10  hitchhiker  5.57295e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2288  phage tail fiber protein  48.31 
 
 
546 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1639  hypothetical protein  27.67 
 
 
374 aa  55.1  2e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1872  hypothetical protein  26.52 
 
 
374 aa  52.8  9e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.573397 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3764  hypothetical protein  27.54 
 
 
494 aa  51.6  2e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4120  hypothetical protein  34.52 
 
 
1371 aa  51.2  3e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.189457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2216  hypothetical protein  30.51 
 
 
423 aa  50.8  4e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3629  hypothetical protein  27.66 
 
 
271 aa  50.4  5e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3370  hypothetical protein  30.67 
 
 
494 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2057  hypothetical protein  33.33 
 
 
494 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3330  hypothetical protein  44.19 
 
 
494 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0254985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1633  hypothetical protein  44.19 
 
 
494 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>