17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2770 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2770  tail fiber domain-containing protein  100 
 
 		 367 aa  728    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00369502  normal  0.0266249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2092  tail fiber domain protein  61.36 
 
 		 475 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4038  tail fiber domain protein  61.36 
 
 		 475 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3936  tail fiber domain protein  82.24 
 
 		 332 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0787  tail fiber protein  30.31 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08310  hypothetical protein  35.96 
 
 		 350 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314349  hitchhiker  0.0000557295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2288  phage tail fiber protein  48.31 
 
 		 546 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1639  hypothetical protein  27.67 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1872  hypothetical protein  26.52 
 
 		 374 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.573397 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3764  hypothetical protein  27.54 
 
 		 494 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4120  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1371 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.189457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2216  hypothetical protein  30.51 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3629  hypothetical protein  27.66 
 
 		 271 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3370  hypothetical protein  30.67 
 
 		 494 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 494 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3330  hypothetical protein  44.19 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0254985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1633  hypothetical protein  44.19 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>