More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2296 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2296  aldo/keto reductase  100 
 
 
345 aa  714  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209933  decreased coverage  4.07872e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2491  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  94.78 
 
 
345 aa  684  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57600  putative oxidoreductase  69.65 
 
 
345 aa  515  1e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.855997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4535  aldo/keto reductase  70.81 
 
 
346 aa  516  1e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0921  aldo/keto reductase  69.94 
 
 
346 aa  515  1e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0900  aldo/keto reductase  70.23 
 
 
345 aa  515  1e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.933192  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22370  Aldo/keto reductase  70.23 
 
 
346 aa  511  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5006  putative oxidoreductase  69.65 
 
 
345 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1314  aldo/keto reductase family oxidoreductase  69.65 
 
 
346 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4410  aldo/keto reductase  69.36 
 
 
346 aa  506  1e-142  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.332653  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4695  aldo/keto reductase  69.08 
 
 
346 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182273  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3243  aldo/keto reductase  63.77 
 
 
344 aa  452  1e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0613024  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3045  aldo/keto reductase  62.9 
 
 
343 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1541  aldo/keto reductase  61.27 
 
 
346 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.941337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1762  aldo/keto reductase  62.29 
 
 
350 aa  434  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384901  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2569  aldo/keto reductase  60.29 
 
 
344 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.133654  normal  0.0183091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2327  aldo/keto reductase  60.87 
 
 
345 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1638  aldo/keto reductase  62 
 
 
350 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.336172 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0032  aldo/keto reductase  60.23 
 
 
346 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1649  aldo/keto reductase  61.14 
 
 
350 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456343  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2478  oxidoreductase  61.71 
 
 
366 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60 
 
 
350 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60 
 
 
350 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1836  aldo/keto reductase family oxidoreductase  59.71 
 
 
350 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0797  aldo/keto reductase family oxidoreductase  59.71 
 
 
350 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1707  aldo/keto reductase family oxidoreductase  59.71 
 
 
350 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.874994  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4726  aldo/keto reductase  60.29 
 
 
350 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0364  aldo/keto reductase family oxidoreductase  59.71 
 
 
350 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1222  aldo/keto reductase family oxidoreductase  59.71 
 
 
350 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1849  aldo/keto reductase family oxidoreductase  59.71 
 
 
350 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00964  oxidoreductase  60.29 
 
 
344 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1504  aldo/keto reductase  60 
 
 
350 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004434  oxidoreductase Tas aldo/keto reductase family  60.58 
 
 
344 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0724585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1588  aldo/keto reductase  60 
 
 
350 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1484  aldo/keto reductase  60.29 
 
 
350 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488323  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1108  aldo/keto reductase  60 
 
 
350 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1565  aldo/keto reductase  60 
 
 
350 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2284  aldo/keto reductase  57.35 
 
 
346 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2624  putative oxidoreductase  58.17 
 
 
347 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.7862  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0199  aldo/keto reductase family oxidoreductase TAS  57.68 
 
 
352 aa  407  1e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3828  putative aldo-keto reductase  58.38 
 
 
346 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0132972  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0979  putative aldo-keto reductase  58.21 
 
 
346 aa  399  1e-110  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.56881e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3243  putative aldo-keto reductase  58.21 
 
 
346 aa  399  1e-110  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.90689e-07  normal  0.0202789 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1031  putative aldo-keto reductase  58.21 
 
 
346 aa  399  1e-110  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0194633  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3664  aldo/keto reductase  57.02 
 
 
349 aa  399  1e-110  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.160957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0899  putative aldo-keto reductase  58.38 
 
 
346 aa  400  1e-110  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3022  putative aldo-keto reductase  58.38 
 
 
346 aa  399  1e-110  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0156973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0855  aldo/keto reductase  56.03 
 
 
347 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0754  aldo/keto reductase  55.62 
 
 
346 aa  391  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3403  putative aldo-keto reductase  56.94 
 
 
353 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000401473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0736  aldo/keto reductase  56.77 
 
 
346 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3202  putative aldo-keto reductase  56.65 
 
 
346 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3379  aldo/keto reductase  55.62 
 
 
346 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0747  aldo/keto reductase  55.33 
 
 
346 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.636269  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3180  aldo/keto reductase  53.89 
 
 
346 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3273  aldo/keto reductase  55.62 
 
 
346 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1391  aldo/keto reductase  55.62 
 
 
346 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0768  aldo/keto reductase  57.83 
 
 
347 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2776  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.75 
 
 
345 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0900  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.33 
 
 
346 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0860  aldo/keto reductase  56.03 
 
 
347 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1865  aldo/keto reductase  53.58 
 
 
346 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000172357  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0753  aldo/keto reductase  55.33 
 
 
346 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0608854  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0848  aldo/keto reductase  55.62 
 
 
346 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.509349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3496  aldo/keto reductase  55.33 
 
 
346 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.496722  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3686  aldo/keto reductase  55.33 
 
 
346 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0158243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3565  aldo/keto reductase  55.33 
 
 
346 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.556648  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0357  putative oxidoreductase, aldo/keto reductase  52.72 
 
 
346 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0398  aldo/keto reductase  52.44 
 
 
346 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.537596  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0511  aldo/keto reductase  54.78 
 
 
356 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0856  aldo/keto reductase  53.89 
 
 
346 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00288116  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02643  hypothetical protein  53.89 
 
 
346 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02682  predicted oxidoreductase, NADP(H)-dependent aldo-keto reductase  53.89 
 
 
346 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2982  putative aldo-keto reductase  53.6 
 
 
346 aa  371  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0288207  normal  0.0122492 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2981  putative aldo-keto reductase  53.6 
 
 
346 aa  371  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.87356e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01770  Aldo/keto reductase  53.74 
 
 
345 aa  369  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3154  putative aldo-keto reductase  53.31 
 
 
346 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000682822  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3236  putative aldo-keto reductase  54.18 
 
 
346 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0896684  hitchhiker  6.43826e-07 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4101  putative aldo-keto reductase  53.6 
 
 
346 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000408733  hitchhiker  0.00103859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3173  putative aldo-keto reductase  54.18 
 
 
346 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.981924  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3155  putative aldo-keto reductase  54.18 
 
 
346 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0659763  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3336  putative aldo-keto reductase  54.18 
 
 
346 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  0.0101445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3275  putative aldo-keto reductase  53.31 
 
 
346 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3221  putative aldo-keto reductase  54.18 
 
 
346 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  hitchhiker  0.000238185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0881  putative aldo-keto reductase  53.31 
 
 
346 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0848488  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5010  aldo/keto reductase  53.31 
 
 
345 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.250615  normal  0.714816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3028  putative aldo-keto reductase  53.6 
 
 
346 aa  368  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.22385e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0400  aldo/keto reductase  54 
 
 
346 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1125  aldo/keto reductase  55.14 
 
 
351 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1526  aldo/keto reductase  54.52 
 
 
347 aa  362  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0830  aldo/keto reductase  50.43 
 
 
345 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2669  aldo/keto reductase  49.28 
 
 
345 aa  346  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.634348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1120  aldo/keto reductase  51.01 
 
 
348 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00427173  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1212  aldo/keto reductase  52.12 
 
 
352 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4994  aldo/keto reductase  52.27 
 
 
350 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570117  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0743  aldo/keto reductase  51 
 
 
347 aa  336  4e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357174  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3708  aldo/keto reductase  50.29 
 
 
345 aa  336  4e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1316  aldo/keto reductase  50.99 
 
 
352 aa  336  4e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1257  aldo/keto reductase  50.29 
 
 
345 aa  332  4e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106908  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1055  aldo/keto reductase  50 
 
 
347 aa  331  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>