More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0522 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0522  glutathione synthetase  100 
 
 
325 aa  675    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  hitchhiker  0.0017539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2033  glutathione synthetase  82.5 
 
 
327 aa  560  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1752  glutathione synthetase  82.5 
 
 
327 aa  558  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.925359  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  51.91 
 
 
318 aa  358  6e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  55.44 
 
 
319 aa  355  6.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  51.74 
 
 
317 aa  354  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  55.44 
 
 
319 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  54.66 
 
 
317 aa  354  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  55.44 
 
 
319 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  50.79 
 
 
319 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  50.95 
 
 
317 aa  350  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  50.8 
 
 
316 aa  349  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  54.07 
 
 
319 aa  348  9e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  50.64 
 
 
316 aa  346  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  50.95 
 
 
316 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  50.95 
 
 
316 aa  346  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  50.95 
 
 
316 aa  346  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  50.95 
 
 
316 aa  346  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  50.95 
 
 
316 aa  346  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  51.11 
 
 
315 aa  346  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  50.95 
 
 
316 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  50.95 
 
 
316 aa  346  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  53.75 
 
 
316 aa  346  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  51.44 
 
 
317 aa  345  5e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  50.63 
 
 
316 aa  345  5e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  53.42 
 
 
319 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  53.75 
 
 
317 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  50.16 
 
 
316 aa  345  6e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  51.59 
 
 
317 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  51.59 
 
 
317 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  53.42 
 
 
315 aa  345  7e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  51.27 
 
 
317 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  53.75 
 
 
317 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  50.79 
 
 
317 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  50.96 
 
 
316 aa  343  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  51.76 
 
 
315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  51.11 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  53.75 
 
 
317 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  50.79 
 
 
315 aa  342  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  50 
 
 
316 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  50.48 
 
 
315 aa  342  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  53.42 
 
 
317 aa  341  8e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  50.48 
 
 
315 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  52.75 
 
 
320 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  50.16 
 
 
315 aa  339  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  52.63 
 
 
317 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  54.42 
 
 
317 aa  338  7e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  52.63 
 
 
317 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  49.84 
 
 
315 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  50.16 
 
 
315 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  50.16 
 
 
315 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  50.16 
 
 
315 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  50.16 
 
 
315 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  48.9 
 
 
328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  52.44 
 
 
318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  49.84 
 
 
315 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  50 
 
 
318 aa  335  5e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  50.94 
 
 
319 aa  334  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  50.63 
 
 
319 aa  333  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  49.68 
 
 
317 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  51.94 
 
 
329 aa  332  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  49.67 
 
 
310 aa  332  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  50.47 
 
 
317 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  49.36 
 
 
320 aa  330  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  50.48 
 
 
318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0057  glutathione synthase  50.79 
 
 
317 aa  322  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  49.36 
 
 
321 aa  317  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  47.7 
 
 
313 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  45.25 
 
 
322 aa  300  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5994  glutathione synthetase  45.66 
 
 
316 aa  298  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000842498 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2517  glutathione synthase  46.52 
 
 
315 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1954  glutathione synthetase  45.37 
 
 
313 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.280823  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0201  glutathione synthetase  45.89 
 
 
323 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137628  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  45.4 
 
 
318 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  45.4 
 
 
318 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  45.4 
 
 
318 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  45.4 
 
 
318 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0528  glutathione synthetase  45.11 
 
 
318 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  45.4 
 
 
318 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  45.4 
 
 
318 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2918  glutathione synthetase  46.71 
 
 
318 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  45.4 
 
 
318 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2780  glutathione synthetase  46.71 
 
 
318 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417394  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0220  glutathione synthetase  46.15 
 
 
323 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  45.57 
 
 
324 aa  295  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0482  glutathione synthetase  44.37 
 
 
317 aa  295  8e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.580777  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6192  glutathione synthetase  45.28 
 
 
318 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  47.56 
 
 
314 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  44.76 
 
 
318 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0180  glutathione synthetase  45.34 
 
 
316 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3736  glutathione synthetase  43.63 
 
 
317 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  0.0329073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3909  glutathione synthetase  46.3 
 
 
315 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0259  glutathione synthetase  45.89 
 
 
318 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3256  glutathione synthetase  43.31 
 
 
316 aa  288  9e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0915852  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1810  glutathione synthetase  45.34 
 
 
319 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0440  glutathione synthetase  44.34 
 
 
318 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735138  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1811  glutathione synthetase  44.94 
 
 
319 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2409  glutathione synthase  45.48 
 
 
314 aa  286  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0765  glutathione synthetase  42.99 
 
 
315 aa  286  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.932033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0432  glutathione synthetase  45.48 
 
 
317 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>