More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1104 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  63.64 
 
 
500 aa  677  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  69.65 
 
 
494 aa  726  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  60.57 
 
 
496 aa  654  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  9.10223e-06  decreased coverage  9.61259e-09 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  67.56 
 
 
498 aa  704  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  63.65 
 
 
501 aa  669  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  60.57 
 
 
496 aa  654  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.18027e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  69.45 
 
 
494 aa  726  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35699e-10 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  73.15 
 
 
502 aa  788  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  70.06 
 
 
494 aa  728  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  70.71 
 
 
505 aa  749  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  62.75 
 
 
496 aa  664  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  59.96 
 
 
498 aa  649  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  60.98 
 
 
496 aa  655  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.55688e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  72.75 
 
 
502 aa  786  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  60.98 
 
 
496 aa  655  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  61.41 
 
 
507 aa  636  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  72.75 
 
 
502 aa  786  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  70.67 
 
 
494 aa  737  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  70.47 
 
 
494 aa  735  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  72.71 
 
 
503 aa  791  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  66.74 
 
 
498 aa  697  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  80.56 
 
 
505 aa  862  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  59.96 
 
 
509 aa  637  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  62.78 
 
 
496 aa  642  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.99841e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  70.47 
 
 
494 aa  739  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  75.05 
 
 
505 aa  806  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  68.43 
 
 
495 aa  707  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3168  glycerol kinase  69.28 
 
 
507 aa  734  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119094  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  62.47 
 
 
494 aa  651  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  96.79 
 
 
499 aa  1011  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  70.02 
 
 
504 aa  745  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  72.55 
 
 
502 aa  783  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  72.65 
 
 
502 aa  792  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  3.11367e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  69.86 
 
 
493 aa  725  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  70.2 
 
 
495 aa  742  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  100 
 
 
501 aa  1041  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  69.25 
 
 
494 aa  726  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  63.89 
 
 
498 aa  677  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  72.75 
 
 
502 aa  786  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  72.92 
 
 
507 aa  799  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  62.88 
 
 
496 aa  666  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  60.77 
 
 
496 aa  654  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  2.69449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  63.36 
 
 
497 aa  677  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  96.79 
 
 
499 aa  1009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  72.75 
 
 
502 aa  786  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  69.8 
 
 
495 aa  724  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52847e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  72.75 
 
 
502 aa  786  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  72.75 
 
 
502 aa  786  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  72.55 
 
 
502 aa  783  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  59.96 
 
 
498 aa  649  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  72.55 
 
 
502 aa  783  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  80.95 
 
 
505 aa  867  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  72.55 
 
 
502 aa  783  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  69.45 
 
 
494 aa  726  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  61.54 
 
 
498 aa  647  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  61.18 
 
 
496 aa  659  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.15642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  72.92 
 
 
507 aa  799  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  72.75 
 
 
502 aa  784  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  68.21 
 
 
505 aa  732  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  72.75 
 
 
502 aa  786  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  72.92 
 
 
507 aa  799  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  73 
 
 
503 aa  798  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  60.98 
 
 
496 aa  655  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.37015e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  60.98 
 
 
496 aa  655  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.62863e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  72.75 
 
 
502 aa  786  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  83.94 
 
 
501 aa  901  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  64.21 
 
 
505 aa  668  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  86.97 
 
 
500 aa  917  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  61.74 
 
 
507 aa  683  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  60.77 
 
 
496 aa  654  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.30334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  63.37 
 
 
497 aa  663  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  59.96 
 
 
501 aa  636  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  68.81 
 
 
505 aa  737  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  67 
 
 
501 aa  680  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  60.77 
 
 
496 aa  654  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  83.53 
 
 
501 aa  896  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  62.37 
 
 
494 aa  659  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  96.59 
 
 
499 aa  1010  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  59.55 
 
 
499 aa  644  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  72.75 
 
 
502 aa  786  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  73 
 
 
503 aa  795  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  63.36 
 
 
496 aa  639  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  63.84 
 
 
500 aa  675  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  73.85 
 
 
503 aa  798  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  69.45 
 
 
494 aa  719  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  60.56 
 
 
499 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  62.45 
 
 
499 aa  628  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  59.96 
 
 
499 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  58.65 
 
 
518 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  58.65 
 
 
518 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  58.65 
 
 
518 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  58.65 
 
 
518 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  58.65 
 
 
518 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  61.73 
 
 
496 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  57.83 
 
 
510 aa  623  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.50114e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  58.25 
 
 
505 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  58.75 
 
 
500 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  58.68 
 
 
503 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  59.15 
 
 
499 aa  618  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  58.68 
 
 
503 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>