24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0392 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0392  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  200  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000101925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  63.92 
 
 
104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0694  hypothetical protein  69.39 
 
 
103 aa  110  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000327351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0582  hypothetical protein  59.6 
 
 
104 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000451193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0595  hypothetical protein  59.6 
 
 
104 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0639  hypothetical protein  62.89 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2461  hypothetical protein  59.6 
 
 
284 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2896  hypothetical protein  46.38 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.63466e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1386  hypothetical protein  48.48 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000365631  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  37.08 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0385  hypothetical protein  43.64 
 
 
81 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4341  hypothetical protein  32.99 
 
 
115 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1763  hypothetical protein  42.31 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.303633  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  37.18 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  32.14 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0532  hypothetical protein  31.91 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094496  unclonable  0.000000000020236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0362  hypothetical protein  31.91 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2920  hypothetical protein  39.29 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1336  hypothetical protein  33.8 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175238  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2275  hypothetical protein  34.62 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  51.35 
 
 
204 aa  41.6  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0166  hypothetical protein  40.38 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.742755  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0438  hypothetical protein  35.29 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>